两种家猪心脏组织表达序列标签的分析

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ESTs(Expressed Sequence Tags)是从已建好的cDNA文库中随机挑取克隆,从5’末端或3’末端对插入的cDNA片段进行一轮单向自动测序,所获得的约60-500bp的一段cDNA序列。 在哺乳动物中,基因组序列的大部分都是不表达的序列,而ESTs测序可以快速的得到表达基因的部分序列。因此,通过ESTs测序可以高效率高通量的进行基因识别,如在同一物种中搜寻基因家族的新成员,在不同物种间搜寻功能相同的基因,搜寻已知基因的不同剪接模式,及基因预测、基因图谱的绘制。此外,大规模ESTs测序还可以提供特定组织或发育阶段基因表达的数量信息,通过对不同组织或发育阶段基因表达数量差异的分析,有助于加深人们对基因功能、基因间相互关系的认识。 本研究选取丹麦成年长白母猪的心脏、肌肉、主动脉、左心室和中国成年二花脸母猪心脏共5个组织,建立相应的cDNA文库,在此基础之上测定了35180条表达序列标签。通过比较分析长白猪4种组织的基因表达谱,找出了长白猪心脏组织中3个显著高表达的功能群和47个显著高表达的基因。长白猪心脏组织在分子伴侣活动、马达活动和生理过程中表达的基因较多,47个显著高表达的基因都是和运动、运动调节、能量及保护有关的基因。两种家猪心脏组织表达差异显著的基因有74个,并且绝大部分是在长白猪心脏中表达更高,显示出长白猪心脏组织生理活动的高效与旺盛。
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