肘管综合征中弓状韧带miRNAs的实验研究

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【目的】肘管综合征(Cubital tunnel syndrome,CuTS),也称迟发性尺神经炎,是第二常见的周围神经卡压病变。肘部的创伤及慢性劳损可以导致弓状韧带出现肥厚增生,引起尺神经卡压磨损,这是CuTS最常见的病因。在此本课题组选用微阵列芯片检测弓状韧带中差异表达的microRNAs(miRNAs)并行生物信息学分析,进一步对相关通路进行验证,期望为CuTS的发病机制和病因学研究提供新的思路。【方法】1.3例弓状韧带标本及3例对照屈肌总腱旁腱性组织标本均收集自2014年8月至2014年11月期间于天津医科大学总医院行肘部尺神经松解前移手术患者。常规提取总RNA并行微阵列芯片分析,qRT-PCR用于验证部分miRNAs表达一致情况。2.miRWalk2.0软件用于预测靶基因。Cytoscape3.0软件制作miRNAs与相应靶基因关系网络图。DAVID6.7软件、Bioconductor基因注释软件用于靶基因的GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。通过Cluster3.0软件对miRNAs及通路行聚类分析。3.构建人皮肤成纤维细胞系(Human skin fibroblast cell lines,HSF),并转染miR-146b-5p过表达(miR-146b-5p mimic)及反义干扰载体(anti-miR-146b-5p),通过qRT-PCR及Western-Blot技术检测纤维化指标COL1A1、COL3A1、Fibronectin(FN)、SMAD4及TGFB1,从而明确miR-146b-5p影响纤维化是否与TGF-β/SMAD4通路有关。【结果】在弓状韧带组织中差异表达的miRNAs共有70个(P<0.05),其中上调3个(hsa-miR-422a、hsa-miR-7855-5p、hsa-miR-1343-3p);下调67个(hsa-miR-196a-5p、hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-297、hsa-miR-21-3p、hsa-miR-595、hsa-miR-663b、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-185-3p等)。qRT-PCR验证结果表明hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-146b-5p和hsa-miR-21-3p表达与芯片结果一致。通过miRWalk2.0软件共发现1804个预测靶基因。对靶基因分析后发现大部分靶基因主要受7个miRNAs(hsa-miR-146b-5p,hsa-miR-21-3p,hsa-miR-185-3p,hsa-miR-615-5p,hsa-miR-659-3p,hsa-miR-663a和hsa-miR-760)的调控。通过Cluster3.0软件对miRNAs行聚类分析,结果可见hsa-miR-146b-5p与hsa-miR-196a-5p、hsa-miR-659-3p功能相聚类,hsa-miR-21-3p与hsa-miR-297功能相聚类。对全部靶基因分析发现,WNT2、TGFB1、FGF1等均为差异miRNAs的高频靶基因并参与体内蛋白质代谢过程,细胞生长调节,细胞周期过程,细胞分裂,细胞代谢过程,信号传导等生物过程。KEGG通路分析示靶基因主要集中在粘着连接、粘附斑、轴突导向、赖氨酸降解、其他多糖降解、细胞粘附分子(Cell adhesion molecules,CAMs)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、逆行内源性大麻素信号、粘多糖的生物合成-硫酸乙酰肝素/肝素和神经营养因子的信号转导通路及其他8条通路。通过Cluster3.0软件对全部通路行聚类分析,发现粘附斑与ErbB信号通路功能相聚类,粘着连接与CAMs功能相聚。MAPK、粘附斑信号通路和预测靶基因关系最紧密。qRT-PCR及Western-Blot验证发现miR-146b-5p mimic组中COL1A1、COL3A1、FN、SMAD4及TGFB1各纤维化指标均下调,anti-miR-146b-5p组中各纤维化指标均上调。【结论】通过分析CuTS患者中退变增生性弓状韧带与对照腱性组织的miRNAs表达,发现了多个差异表达的miRNAs,并获得了潜在的靶基因及信号通路,为初步研究CuTS中弓状韧带增生肥厚的发病机制提供了线索。
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