孟德尔遗传病是由于核DNA单一位置的碱基改变导致的遗传性疾病。在一个特定的家系中,疾病的致病原因比较单一；但不同的家系往往具有其独特性。本课题中我们获得了三个遗传病家系,分别为上皮基底膜营养不良家系、福克斯角膜内皮营养不良与白癜风家系和神经性肌强直家系,并采用多种方法对致病突变进行定位研究。对于上皮基底膜营养不良,已有研究表明该疾病与TGFBI基因的突变有关。我们通过设计引物对所获得的患病家系中两个患病样本的TGFBI基因的编码序列进行测定；我们发现该基因的外显子上存在一个新的杂合非同义突变(chr5:135420318_C/A, NCBI36/hg18),软件预测表明该碱基的变化会造成TGFBI蛋白序列上第538位氨基酸发生变化,从而影响蛋白的功能。对家系中所有样本进行测序,测序结果表明在该家系中患者均含有该杂合突变,健康人除去IV7外均不含有该突变。考虑到该疾病的发病时间较晚,成员IV7年龄较小,我们认为TGFBI基因上的突变(chr5:135420318_C/A, NCBI36/hg18)是该家系的致病突变,家系成员IV7会在未来发病。对于福克斯角膜内皮营养不良与白癜风,已有研究采用关联分析和连锁分析的方法得到了大量的候选基因。由于候选基因过多,对其进行Sanger测序成本较高,我们共选择了四个样本进行外显子组测序。在家系中对新发现的126个SNV/Indel位点进行分析及验证,结果没有发现与福克斯角膜内皮营养不良疾病共分离的突变；针对于白癜风,我们发现多个新的非同义杂合SNV出现在所有已发病成员和个别未发病成员中,但这些位点所在的基因尚无与白癜风发生相关的报道。由于白癜风发病年龄跨度较大,个别成员可能尚未到发病年龄,所以无法排除这些SNV的致病性。同时,我们对家系中的样本进行了全基因组SNP分型,由于样本数目不足,CNV分析及连锁分析没有能够为致病突变的寻找提供确定的信息。考虑到样本测序深度不足,未来我们考虑对样本进行更大范围以及更大深度的测序,以期找到与福克斯角膜内皮营养不良相关的突变。对于神经性肌强直,已有报道的研究认为该病与KCNA1、KCNQ2和KCNQ3钾离子通道蛋白基因有关。我们通过设计引物对所获得的患病家系中先证者的三个离子通道蛋白基因的编码序列进行测定,没有发现与疾病共分离的突变。我们选择了两个患病样本进行外显子组测序。对外显子组测序数据分析得到的位点进行验证和分析,结果并没有找到在家系中与疾病共分离的SNV/Indel位点。在此基础上我们对家系中的16个样本进行了全基因组分型。连锁分析结果发现部分LOD值较高的区域,提示我们该家系疾病的发生可能是由于基因非编码区的突变引起的。未来我们考虑对连锁区域进行深度测序,期望发现非编码区域的致病突变。