无论对于国家还是企业来说，获取竞争优势的研究开发活动的重要性不言而喻，通过增加研发投入强度来提升创新能力以面对激烈的市场竞争并保证企业稳定成长，已成为人们的共识。但已有一些研究结果表明企业R&D投入并不是投入越多，企业的业绩会越好。权变理论要求考虑企业内外因素对二者关系的影响，即将这些内外因素以调节变量的模式引入模型当中。　　研发活动中存在委托代理问题，它可能导致企业研发活动效率的降低。深入剖析企业研发活动中的委托代理问题，有利于更高效地管理研发活动，提高研发活动的效果和效益。因此，本文在实证企业研究开发投入与企业财务绩效的关系，引入公司治理结构这一调节变量，深入研究二者的关系。　　根据已有的有关R&D投入对企业财务绩效的影响、公司治理对R&D投入与企业财务绩效关系的影响的理论成果，基于委托代理理论和公司治理理论，从有效缓解委托代理问题的监督与激励这两个手段出发，研究高新技术企业R&D投入强度与财务绩效的关系及滞后性影响，以及公司治理对研发投入与财务绩效关系的调节作用。本文以高新技术上市企业为研究样本，通过实证分析检验本文提出的研究假设，并得出以下结论:一、使用当期企业绩效、滞后一期的企业绩效、滞后两期的企业绩效分别与当期的R&D投入强度进行回归分析，结果表明R&D投入对财务绩效的影响存在滞后性;第二，高新技术上市企业的R&D投入强度与企业绩效存在先升后将的倒U型关系，在一定范围内，高新技术上市企业的R&D投入强度对其财务绩效确实存在积极的影响，但超过一定范围后，通过增加R&D投入，则不利于企业绩效的提升;第三，在研究公司治理的调节作用时，与当前通常将公司治理结构的众多指标分开研究调节效应不同的是，本文使用主成分分析法，建立公司治理结构的指标体系计算得出公司治理指数，以此研究公司治理的调节作用。通过层次回归分析发现，高新技术上市企业的R&D投入强度与公司治理变量的交互项系数通过了显著性检验，表明良好的公司治理的确能够正向促进R&D投入对企业财务绩效的影响。