注册会计师对上市公司财务报告质量出具的鉴证结果—审计报告，是作为独立于财务报表编制者和使用者的第三方出具的具有合理保证的结果。审计意见是揭示上市公司财务信息是否真实可靠的关键，是财务报表使用者及其他利益相关者重要的信息来源。要研究如何出具符合要求的审计报告，一定要考虑各种相关因素。本文在介绍审计意见相关理论的基础上，结合国内外关于审计意见影响因素研究，通过汇总我国全体上市公司审计意见行业分布情况，提出审计意见应分行业进行分析，并在简要分析的基础上，结合国家相关政策与会计准则与法规对房地产行业着重分析；分类汇总并对比了近三年来房地产行业和制造业导致非标准审计意见的因素，以此选取能够代表这些因素的10项指标，提出相应的假设进行实证研究，首先将各项指标在不同审计意见下、不同行业下进行描述性统计分析，初步检验假设是否成立，然后将两种行业分别运行SPSS16.0进行Logistic回归分析。实证结果显示两种行业的影响因素不完全相同，存在一定的差异性：房地产行业主要受流动比率、净资产收益率、实际所得税率、非经常性损益影响显著；而制造业主要受审计费用自然对数、流动比率、资产负债率、净资产收益率、非经常性损益、预计负债等因素显著影响。本文研究结论为：收到标准审计意见的公司与收到非标准审计意见的公司在指标上存在差异性；不同行业审计意见类型的影响因素也不完全相同。本文的研究对审计人员、财务报告使用者、社会公众、政府监管单位和其他利益相关者具有一定的参考价值，如注册会计师可以用来降低审计风险和诉讼风险，其他利益相关者可以用来降低投资风险，监管单位可以用其来判断审计意见类型的合理性，维持审计市场秩序。