金柑果皮油胞特性和相关调控基因表达量的研究

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金柑果实是柑橘类水果中可以带皮食用的果实,其果皮油胞的大小、数量、内含物等直接影响食用品质。因此,本试验以金柑油胞为出发点,以油胞较多的普通品种融安金柑、油胞较少的芽变品种滑皮金柑、油胞最少的芽变品种脆蜜金柑为试材,研究三个品种间果实品质,油胞大小、数量差异;并对三个品种果实果皮转录组测序,通过差异基因分析油胞形成的相关调控基因;再用测定参选基因在各个时期的表达量,分析这些基因在果实发育过程中的不同表达,预测这些基因与油胞发育过程的关系;旨在为应用基因工程培育油胞精油含量较少的优质金柑提供理论依据。1.脆蜜金柑、融安金柑、滑皮金柑三个品种之间,果皮油胞数量从果实生长初期则已表现出来。随着果实的成熟,果皮油胞密度则略有下降。单位果皮面积内油胞含量最多的是融安金柑、滑皮金柑次之、脆蜜金柑最少。融安金柑和滑皮金柑果实赤道部密度最小,果实顶部密度最大。2.脆蜜金柑呈现出果大、果重、油胞含量少、可食率高、果汁率高、可溶性固形物含量高、蔗糖含量高、总糖含量高、含酸量低的优点,在口感上呈现出辛辣味小、皮脆、汁多、肉厚、甜蜜少酸的特点。3.对三个金柑品种进行转录组测序,共获得36093条基因。将获得的基因与蛋白质数据库进行比对,对其功能进行注释和分类。比对到NR数据库的基因有20973条,占总基因数的58.11%;在GO得到功能注释和预测的基因有20973条,占组装转录本的58.11%。4.36093条基因在融安金柑(对照组)、滑皮金柑、脆蜜金柑三个转录组文库中进行表达量差异比较分析,获得8113个差异表达基因DEGs。6融安金柑和滑皮金柑比较,有DEGs1417个上调表达,277个下调表达。融安金柑和脆蜜金柑比较,有DEGs3134个,1514个下调。滑皮金柑和脆蜜金柑比较,有DEGs757个上调表达,1014个下调表达。5.8113个DEGs进行GO显著富集分析,融安金柑和滑皮金柑比较、融安金柑和脆蜜金柑比较、滑皮金柑和脆蜜金柑比较分别有12个、28个、22个显著性富集的GO term。6.通过与NR库比对,200条基因编码了超过46种不同类别的转录因子,参与烯类等物质调控有关的AP2/ERF和WRKY转录因子,在融安金柑和滑皮金柑比较中有AP2/ERF转录因子4个;在融安金柑和脆蜜金柑比较中,WRKY转录因子26个,在滑皮金柑和脆蜜金柑比较中,有WRKY转录因子18个。7.筛选获得135条DEGs可能编码油胞精油成分烯萜类、酮类物质的5条调控酶基因和5条转录因子。预测金柑油胞相关物质的控制基因可能是在类黄酮生物合成途径中,控制柚皮素-3-双加氧酶促进柚皮素、二氢槲皮素等物质合成的酶基因Unigene0008513和调控新薄荷醇脱氢酶促进薄荷醇合成的Unigene0000766酶基因。
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