采用基于Gene Ontology的聚类方法研究白血病的遗传异质性

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采用基于基因功能分类体系Gene Ontology的样本二分聚类方法,结合基因表达谱数据,来研究基因功能模块与疾病异质性之间的关系。对两套白血病基因表达谱数据进行了分析,将富集有高变异基因的Gene Ontology基因功能模块作为特征功能模块,以这些特征功能模块为聚类特征,将疾病样本聚类为两类,通过对比原始标签,来分析这些特征功能模块与疾病异质性之间的关系。实验结果显示:两套白血病基因表达谱数据得到的特征功能模块趋于一致;与传统的聚类评估指标ARI相比,采用用新的聚类评估指标,能够进一步分析特征功能模块与白血病亚型之间的相关程度。
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