改革开放四十多年,随着我国的经济快速发展、物质需求的不断增加,随之产生了经济发展与资源环境之间的矛盾。农业在我国国民经济中的地位不容小觑,并且占据了基础性地位,所以相对于第二产业和第三产业来说,农业对于生态环境的依赖性更大。当前,各行各业发展迅速,面对日益增长的资源短缺和环境污染等问题,怎样在“保量”的同时兼顾到“保质”,基于此,如何引导我国的农业发展由粗放型的农业生产逐步转化为绿色可持续发展就成了当前的首要工作。农业生态效率不仅仅是衡量某一地区农业生产力的重要指标,更是能反映出其经济、资源、环境之间协调发展水平的重要指标。所以农业生态效率就成为了刻画农业综合发展水平的衡量指标,进行农业生态效率的研究对于农业的可持续发展有着重要的意义。新疆作为我国干旱地区的典型代表,干旱缺水的特点就使得新疆的生态环境极其脆弱。同时,新疆又属于我国的资源型地区,石油、煤炭、天然气等战略资源的存储量位居全国前列。然而这两方面又正是制约着新疆经济发展、导致南北疆发展不均衡以及生态环境破坏的原因。新疆经济发展的基础性产业就是农业,其发展不仅关系到新疆的经济发展和可持续发展,更关系到新疆的社会稳定。为了更有针对性地解决以上问题,促使新疆农业生态效率的提高,本文选取了2009年—2018年连续十年的研究周期,以新疆及其14个地州市作为研究对象。通过对已有的研究成果和相关文献的整理分别从土地投入、劳动力投入、资本投入、水资源投入、中间投入以及农林牧渔业总产值六个方面构建出评价新疆农业生态效率的投入产出指标体系,本文在实证分析的过程中主要使用了DEA模型来评价新疆的农业生态效率。在本论文的实证部分中,首先使用DEA—CCR模型测度在规模报酬不变的情况下新疆整体的农业生态静态效率水平,并对14个地州市展开研究分析;其次,使用DEA—BBC模型测度在规模报酬改变的情况下新疆整体的农业生态静态效率水平,并对14个地州市展开研究分析。为了更进一步地研究新疆农业生态效率,接着再使用DEA—Malaquist模型从全要素生产率指数、综合技术效率指数、纯技术效率指数和规模效率指数的动态变化出发对新疆农业生态动态效率进行研究分析。最后,通过建立Tobit回归模型找出影响新疆农业生态效率的主要因素。通过研究分析主要得出以下结论:第一,在2009年—2018年期间,新疆农业生态效率总体上呈现出逐年上升的趋势;第二,新疆农业生态效率整体偏低,并且地区之间的农业生态效率存在着显著的差异。生态效率较低的地区,在农业生产的过程中仍然处于“高投入、低效率”的粗放型传统发展模式,这就使得本身就非常脆弱的生态环境变得更加脆弱;第三,从DEA—Malaquist模型的分析结果中可以看出,在提升新疆农业生态效率的过程中,技术进步指数贡献程度占据首位,成为了提高新疆农业生态效率的主要促进因素,而综合技术效率指数和纯技术效率指数以及规模效率指数相对来说对于新疆农业生态效率的提高起着一定程度上的制约作用,所以政府更应该大力扶持这些方面,进行统筹规划从而实现新疆农业生态效率区域内的协调发展。第四,通过建立Tobit回归模型来找寻影响新疆农业生态效率的因素,可以发现经济发展程度、农业机械化密度、农业规模化水平、城镇化与新疆农业生态效率呈正向关系,随着三者的提高,新疆农业生态效率也会相应的提高。农民收入水平与新疆农业生态效率呈U型关系,当农民收入水平较低时,通常会使用大量化学物来提高产量,从而破坏了生态环境,当农民收入水平达到一定水平之后,便会意识到生态环境的重要性。对外开放水平在现阶段对于新疆农业生态效率没有显著的影响关系。在对新疆农业生态效率测度评价后,根据实证分析结果从完善农村基础设施建设、健全相关制度体系、增加经济作物的种植比重、加强研发和推广农业生产新技术、拓展新疆农业资源的新功能以及加快推进新疆城镇化进程这几个方面提出相关对策建议。