随着高等教育改革的不断深入，高等学校的办学质量和科研水平得到了显著的提升，政府投入的财政经费也逐年增加，但依然难以满足高校巨量的资金需求。高校只有不断提升经营管理水平和资金利用效率，才能获得更大的发展空间。然而，国内关于高校财务绩效的研究成果还比较少，尚无一套在全国范围内实施的高校财务绩效评价体系。本文在对该课题国内外研究现状进行总结和分析的基础上，建立了包括投入和产出两大类共计31项具体指标的绩效评价指标体系，涵盖了高校的人力、财力、物力等方面的投入和教学、科研等方面的产出。通过对办学层次相当的15所高校的实际数据分析，选取了教师数量、教学经费、科研经费、总资产4个投入指标和在校学生数量、毕业生人均年薪、学术论文数量3个产出指标进行实证分析。并利用引入理想决策单元的DEA模型对样本高校按综合绩效值进行了排序和分析，得出样本高校的财务绩效水平虽然整体良好，但在教师数量、经费和总资产投入上普遍存在冗余，且个别高校的冗余量较大；在学生培养数量上基本饱和，在毕业生人均年薪上稍显不足，而在学术论文数量上存在两极分化现象，有6所需要重大调整，有3所无需调整等结论，并对不满足DEA有效的高校按模型要求提出了各个指标的改进措施。通过实证分析，演示了本文构建的评级体系的可操作性，并希望能对高校财务绩效评价体系的完善和高校财务管理水平的提升提供更多的参考。