财政专项资金作为财政资金的重要组成部分,在中国政府的宏观调控、产业结构升级调整和社会经济建设等各方面起到了决定性的作用。能否管好、用好不仅关系到党和国家方针政策的贯彻落实,关系到国民经济能否真正平稳较快地发展,而且直接影响到人民群众能否真正享受到经济发展所带来的成果。　　随着1994年分税制财政体制改革,我国的主体功能区建设和基本公共服务均等化取得了显著成效,财政专项资金的支出范围和支出规模正在连年增加,支出项目也越来越倾向于民生和社会领域。鉴于此,社会公众开始日益关注这一特殊资金的分配、管理和使用效益等问题。但是,到目前为止,中央并没有对中央政府和地方政府之间以及地方各级政府之间的财政专项资金运作作出统一的规定,这使得其运作存在着一些乱象。在这样特定的时代背景下,我国各级政府部门显然会把地方财政专项资金的管理作为工作的重中之重。　　我国财政专项资金的发展是以资金规模的变化为主线,具体的发展历程可划分为起步发展期、稳定发展期和持续发展期。经过起步发展期和稳定发展期的积淀,目前我国地方财政专项资金已经处于飞速发展的阶段。体现在项目上,就是专项资金的分配极其独特,主要包括经济建设、社会保障、“三农”、医疗卫生、教育科技等各个方面。然而,我国很大一部分地方政府对于财政专项资金的运作管理都只是机械地照搬中央的做法,而没有构建结合本地实情的管理运作模式。这样必然会带来一系列的问题,比如分配方法不规范、分配不及时、使用上违规滥用、监管不力等。　　本文旨在通过分析云南省财政专项资金在立项、拨付、使用、审计、评估等方面的现状,试图结合博弈论的相关理论模型,多角度、多层次地揭示云南省财政专项资金存在的问题,并借鉴国内外的成功事例和经验,总结相关学者提出的合理建议,在此基础上针对性地提出适云南省省情的具体措施,以期能提高专项资金支出效益。