来自卫星病毒RNA的sRNA对宿主基因表达及宿主病理表型影响的研究

来源 :上海师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaoyaya310
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番茄是一种常见的经济作物,而病毒病害的侵袭可造成番茄的大量减产,这包括寄主范围最大的黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)病害,尤其是CMV的寄生分子D satellite RNA(D-sat RNA)的共感染会导致番茄植株特异性的快速死亡,该病害机理及其高度宿主特异性机理都有待阐明。D-sat RNA的致死性感染由其近3’末端处的三个核苷酸决定,对这三个(致死)核苷酸进行突变,突变体sat RNA(Dm-sat RNA)不具有致死性,因此D-sat RNA的致死性具有序列特异性。前期研究进一步发现其致死性与番茄植株中含致死核苷酸的s RNA(D-lethal s RNA)含量相关,并且影响病毒s RNA扩增的番茄rdr6及其共同作用因子sgs3突变体可耐受D-sat RNA的感染。为深入研究高含量D-lethal s RNA在CMV/D-sat RNA所引起的病害中的作用,本论文首先探讨了D-lethal s RNA对番茄基因的表达调控。利用PAREsnip2软件,我们分析了被感染样品的降解组和s RNA文库数据,预测结果表明D-lethal s RNA可能靶标SCC1P2、ERF4、CSF、EIN2、SCMF的m RNA而调控感染细胞中这些基因的表达水平,前期研究发现融合有SCC1P2靶标序列的GFP表达载体在CMV/D-sat RNA感染的烟草叶片中比在Dm-sat RNA感染叶片中的表达水平显著降低。为更明确验证D-lethal s RNA与上述基因的靶标关系,本论文建立了可表达特定D-lethal s RNA的mi RNA或者ds RNA的RNAi载体,在同一构建中还含有融合了相应s RNA所预测的靶标序列的GFP表达载体,利用烟草瞬时表达系统来验证D-lethal s RNA的沉默效应。结果表明ds RNA表达载体本身影响了GFP的正常发光,而mi RNA载体系统验证了融合有ERF4、CSF、SCMF靶标序列的GFP被相应的s RNA沉默。为证明这三个基因的沉默是否和D-sat RNA引起的致死性病害相关,我们利用TRV-VIGS系统对这三个基因共同下调表达,初步结果发现番茄未出现死亡病害。与此同时,我们对SCC1P2、ERF4的靶标序列进行同义突变并在番茄中进行单独和共同过表达,然而D-sat RNA仍然导致转基因植物死亡。综上,特定Dlethal s RNA可靶标ERF4、CSF、SCMF,且回避其靶标的SCC1P2、ERF4并不逆转病害表型,对其它靶标基因的同时同义突变正在进行中,以阐明D-lethal s RNA与D-sat RNA发生致死性感染的内在联系。
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