细菌分子伴侣和效应物蛋白的结构和功能研究

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蛋白质是生命活动的主要承担者,本课题着重于细菌中分子伴侣和效应物这两种蛋白质的研究。其中,分子伴侣蛋白是一类可以防止生物体内蛋白质聚集沉淀,并帮助其正确折叠的蛋白质,分子伴侣及其与底物间的相互作用对于细胞在正常和压力环境中保持一个健康的内稳态发挥着关键的作用。而效应物蛋白则是病原菌分泌到宿主中的一类蛋白质,能够帮助病原菌侵染宿主的组织,压制宿主免疫系统、帮助病原菌在宿主中的存活,在病原菌侵染宿主的过程中发挥着重要的作用。  致力于发现新的非ATP-依赖型分子伴侣,注意到E.coli中的周质蛋白Asr,其基因在低pH条件下会被显著诱导。蛋白Asr对E.coli在中等酸性条件下的生长必不可少,asr在其他肠道细菌中的同源物同样能够被酸所诱导,表明asr可能是细菌应对酸压力的一种保守组分。本论文着重验证了asr基因对E.coli在低pH条件下生长的重要性。纯化得到目标蛋白Asr,通过其抑制模式底物—苹果酸脱氢酶(MDH)形成聚集沉淀的能力来验证Asr的分子伴侣活性。发现,Asr能够以30的摩尔比(Asr∶MDH)在pH4.2-5.0的范围内抑制酸激所导致的MDH聚集沉淀。有趣的是,这个范围与已知的酸激分子伴侣HdeB发挥作用的pH范围重叠。通过远紫外圆二色谱分析,Asr的二级结构在不同的pH(2.0-7.0)条件下没有明显的改变,说明Asr是一种新的非ATP-依赖型的内在无序的分子伴侣。  迟缓爱德华氏菌的周质中发现了两种新的效应物。Trxlp是一种新发现的Ⅳ型分泌系统(T4SS)效应物,其靶向ASK1来抑制Erk1/2-和p38-MAPK信号级联反应,从而提高细菌在宿主内的生存和增殖。EseK是一种T3SS效应物,是细菌定植于斑马鱼所需要的,但其作用机理尚未研究清楚。基于这一前提,本论文致力于这两种新的效应物的结构解析,帮助解释实验现象并促进功能的研究。通过分离纯化获得目标蛋白Trxlp,对其进行晶体条件筛选,得到高质量的晶体,X射线衍射获得1.97(A)的分辨率,最终解析出Trxlp的三维结构。效应物EseK因为稳定性差而无法结晶,通过在其N端连接MBP蛋白促进稳定,并获得高纯度的MBP-EseK蛋白进行晶体条件的筛选,经过后续优化步骤最终获得高质量晶体,X射线衍射同样得到1.97(A)的分辨率,由于密度分布问题暂时未能得到EseK的三维结构。
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