中国加入WTO十六年,通过贸易完成了人均GDP从8,717元到53,980元的飞速发展,年增长率12.1%。在WTO多边贸易体制之外,需求更加紧密的双边和区域经济化贸易合作也风起云涌,逐渐发展起来。在全球区域经济合作的大环境推动下,中国也顺应趋势与东盟十国签订了区域自由贸易协定,在中国-东盟自贸区的框架下(CAFTA),双边的贸易总额从2002年的547.7亿美元增加到2015年的4721.6亿美元,年增长率18.1%。中国-东盟自由贸易协定的签署,形成了更大规模的贸易经济区域,为双边提供了规模经济再实现的机会。本文试图站在创新投入和创新产出两个角度,从微观企业层面具体地定量分析中国-东盟自贸区的建立对中国制造业企业的出口及创新行为的影响,探讨了区域贸易自由化能否解除中国经济发展转型进程中的困境。第一部分,我们介绍了中国的贸易现状和CAFTA的发展进程,以及本文的研究思路和创新点。第二部分,我们整理了相关文献。首先,是中国-东盟自贸区相关文献,发现大多都是观点的描述或者基于静态一般均衡模型以及引力模型的模拟测算;然后,是贸易、企业出口、技术升级以及创新的相关文献,Melitz和Yeaple在理论上开创了新新贸易理论的先河,而后来的学者在实证方面大多以内生化的生产效率(TFP)作为技术水平的衡量,或是仅仅从创新的投入端(技术引进)入手。第三部分,我们介绍了双边贸易理论模型,模型求解了出口阈值与技术采纳阈值,在这个基础上我们加入考虑了企业自主创新阈值。第四部分,我们进行了两个角度的实证。首先,从创新的投入端,以研发部门支出费用作为衡量指标,用WTO关税数据库和中国工业企业数据库进行了 9,068个样本的检验;接着,扩展前一部分实证,从创新的产出端入手,以专利申请数量作为衡量指标,用WTO关税数据库与PATSTAT数据库进行了 6,462个样本的检验。第五部分,总结了本文的分析结果并给出了政策建议。本文的主要结论是,中国-东盟自贸区内贸易合作国的关税削减整体上显著地促进了中国制造业企业的出口、技术采纳和自主创新。其中,对于我国处于中等生产水平的制造业企业来说,出口和技术采纳行为都受到了较大程度的促进;而对于其它生产效率等级的企业来说,仅仅出口受到了一定程度的促进,但技术采纳行为并没有明确的影响方向。此外,我们还发现,贸易自由化对区域内企业的专利创新产生了不同的影响:出口企业的专利创新能力更高,据测算,我国出口企业专利的创新水平增速贡献是非出口企业的4.5倍。