野大豆(Glycine soja)是栽培大豆(Glycine max)的野生祖先种。二者之间的进化关系是研究人员长期关注的问题。国内外学者普遍认为栽培大豆起源于中国,考古学、形态学、植物生理学、生物化学、分子生物学等方面的研究为解决栽培大豆的起源问题提供了多方面的依据,但是栽培大豆具体起源于中国何地至今仍没有定论。本研究选取了覆盖中国东北地区、黄淮海地区及南方地区的22份野大豆材料和3份栽培大豆品种,在果实发育相关功能基因分离的基础上,通过初步的系统发育分析,对不同地区野大豆的进化关系以及野大豆与栽培大豆的进化关系做初步探讨,并为栽培大豆起源后续深入研究提供基本的系统发育信息和资料。　　 野大豆与栽培大豆在果实性状上存在较大差异。结合其他物种果实发育相关研究,选择并分离了如下候选功能基因,并对其进行初步的功能验证:SHATTERPROOF(SHP),FRUITFULL(FUL),SEEDSTICK(STK),APETALA2(AP2),DA1。　　 在进一步查阅文献及初步实验的基础上对大量分子标记进行筛选,最终选择了4个核基因片段(包括两个MADS—box基因片段:APETALA1内含子和SEEDSTICK内含子；两个在其他物种较低分类阶元的分子系统学研究中得到过应用的基因片段:NIA内含子和CNGC4片段)以及5个叶绿体DNA片段(trnH-psbA,psbB-psbH,rps11-rp136,trnT-L,trnS-G)构建系统树。通过对核基因片段和叶绿体DNA片段各自联合序列以及共同联合序列构建最大简约树和贝叶斯树,来分析各地区野大豆之间以及野大豆和栽培大豆之间的进化关系。结果表明:(1)南方地区的野大豆以较高支持率聚在一起,东北地区和黄淮海地区的野大豆聚在一起。说明东北地区和黄淮海地区的野大豆亲缘关系较近,并且各野大豆居群间的亲缘关系与地理分布有密切联系。(2)本研究选择的东北的栽培大豆品种及广东的栽培大豆品种都和南方地区的野大豆聚在一起,显示栽培大豆品种与南方地区的野大豆亲缘关系较近,由此推测栽培大豆很有可能是由南方地区的野大豆驯化来的,然后向黄淮海地区以及东北地区传播。本研究第一次利用DNA序列并且是多基因和DNA片段的DNA序列资料探讨野大豆和栽培大豆之间的进化关系,并支持栽培大豆南方起源。