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随着我国奶牛养殖业的发展,如何实现犊牛的高效健康培育以及泌乳奶牛生产优质奶应当得到充分重视。在此阶段,小肠和肝脏发挥完善的生理功能将是维持其健康生产的关键。然而,关于小肠和肝脏在新生公犊牛以及肝脏在泌乳奶牛上的生理机制了解较少。对此,本研究使用LC-MS/MS蛋白质组学研究策略构建了小肠和肝脏蛋白质表达谱,以期在蛋白质水平为深入了解其生理机制提供参考依据。具体研究内容及结果如下:1.采集出生后约2h未采食初乳的中国荷斯坦公犊牛小肠,构建蛋白质组表达谱。结果显示:十二指肠、空肠和回肠分别鉴定到1184、1616和1127个蛋白质,KEGG通路分析发现,多数蛋白质参与能量代谢通路和免疫应答过程;蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)发现,泛素-40S核糖体蛋白S27a、丝氨酸/苏氨酸-蛋白磷酸酶2A、热激蛋白70、真核生物起始因子4A-III与其他蛋白有更多的相互作用。2.犊牛小肠差异蛋白组学研究。统计分析结果表明:犊牛十二指肠与空肠差异表达蛋白178个;十二指肠与回肠差异表达蛋白218个;空肠与回肠差异表达蛋白373个。在生物学过程,十二指肠与空肠差异表达绒毛蛋白-1和丝束蛋白-1涉及调节微绒毛长度。此外,空肠与回肠差异表达蛋白中涉及肠的吸收有4个、凋亡过程的有26个、T细胞共同刺激的有3个。PPI分析发现,热激蛋白90β、肌动蛋白和细胞色素C氧化酶亚基6B1分别在十二指肠与空肠、十二指肠与回肠以及空肠与回肠差异表达蛋白中与其他蛋白有更多相互作用。3.采集犊牛肝脏,构建蛋白质组表达谱。结果发现,大多数鉴定的蛋白质与葡萄糖、脂肪酸和氨基酸代谢通路相关。PPI分析发现,蛋白激酶Cα、有丝分裂检测点蛋白BUB3、泛素-40S核糖体蛋白S27a和转化蛋白RhoA与其他蛋白质有更多的相互作用。4.采集健康泌乳中国荷斯坦奶牛肝脏,质谱鉴定建立蛋白质表达谱,其中16.7%的鉴定蛋白具有跨膜区域,12.8%的蛋白具有信号肽。GO功能分类发现,多数蛋白在分子功能涉及催化活性和核苷酸结合;KEGG通路分析发现,多数蛋白参与能量、脂和氨基酸代谢通路;PPI分析发现,泛素-60S核糖体蛋白、不均一核糖核蛋白D和热激蛋白90α为关键的PPI节点蛋白。综上所述,本研究构建了新生公犊牛小肠、肝脏和泌乳奶牛肝脏蛋白质表达谱。研究结果在蛋白质水平为深入了解新生公犊牛小肠、肝脏以及泌乳奶牛肝脏生理功能提供参考依据。