改革开放以来，新疆生产建设兵团依靠粗放型的发展方式实现了经济的高速增长。但是，这种粗放型的经济发展方式是不可持续的，因此，兵团经济发展方式要实现可持续发展必须要转变现有经济发展方式。为了明确兵团经济发展方式转变的方向、采用的方法和途径，就需要对兵团经济发展方式的路径选择进行研究。文章基于此目的，在梳理了国内外相关文献和主要理论的基础上构建了由经济、社会、自然三大系统组成的兵团经济发展方式转变测评指标体系，测评了2000-2012年间兵团经济、社会、自然各系统的发展程度，经济-社会-自然三大系统协调度和经济发展方式总体转变程度，并且采用模糊综合评价法对2000-2012年间兵团经济发展方式转变所处的阶段进行判断并深入分析。得出以下重要结论：第一，2000-2012年，兵团经济、社会、自然这三大系统发展程度不断提高。其中自然系统提高最快，社会系统最慢。经济-社会-自然系统协调度水平一直在0.5左右徘徊，处于较低的协调水平。2000-2007年，兵团经济发展方式转变程度提高缓慢，2008-2012年，明显加快。第二，2000-2012年间，兵团经济发展方式转变状况可以划分为两个阶段：2000-2006年，兵团经济发展方式转变处于为转变做准备阶段，2007-2012年，上升为初步转变阶段。第三，通过对兵团经济发展方式转变测评指标体系中三大系统各指标与经济发展方式转变阶段临界值的比较发现，兵团经济发展方式转变过程中的主要问题有经济结构不合理、经济效率低下、创新对经济增长驱动动力不足。第四，从经济发展方式转变的现实障碍来看，兵团经济发展方式转变的现实障碍主要有：传统粗放型发展观念制约、经济增长方式转变一般规律制约、经济体制制约。由此导致兵团经济发展方式转变路径所呈现对投资的依赖、对廉价劳动力的依赖和对资源环境的依赖等特征。第五，从国内外发达地区经济发展方式转变的经验看，对兵团经济发展方式转变的启示主要有：体制机制创新是保障、科技创新是支撑、结构优化升级是关键、发展循环经济是必由之路。因此，应该借鉴以上经验结合兵团经济发展方式转变的方向进行兵团经济发展方式转变的路径选择：调整经济结构、依靠科技进步与自主创新、发展循环经济。相应的保障措施有：解放思想，转变观念；深化机制体制改革；加大创新投入与人力资本建设。