玉米南方锈病和茎腐病的发生流行给玉米生产造成了严重的损失,利用分子标记技术对国内骨干自交系进行抗病性改良,建立抗南方锈病和抗茎腐病的近等基因系,对于发掘和利用抗病基因资源、筛选和培育抗病品种,是控制病害蔓延的有效途径。本实验在前人研究的基础上,利用对玉米南方锈病和茎腐病表现高抗的自交系齐319和1145为供体亲本,京24为受体亲本,通过杂交,回交等手段,分别构建出了以京24为遗传背景分别抵抗南方锈病和茎腐病的近等基因系,并采用分子标记辅助选择方法,筛选出了在双亲之间高多态性的前景引物和背景引物,结合南方锈病和茎腐病的田间抗病表型鉴定,获得了纯合抗南方锈病和抗茎腐病京24改良系。将京24(抗南方锈病)和京24(抗茎腐病)的中选单株进行杂交,得到了聚合两种抗病基因的自交系群体。应用荧光标记技术与多重引物复合电泳技术相结合,明显提高了检测效率,使结果更精确可靠,达到了使用较低的检测成本获得理想选择效果的目的,与聚丙烯酰胺凝胶电泳相比,显著提高了分子标记背景选择的效率,为高通量的SSR标记检测平台的深入研究和发展奠定了基础。研究结果：从14对前景引物中最终筛选出与南方锈病抗病基因遗传距离较近、扩增稳定、分别位于抗病基因上下游的两对引物phi118和p2,用于目标性状的前景选择。460个BC2代单株的室内分子标记检测结果和海南自然发病情况的比较验证了前景选择标记的有效性。可以看出,对于像南方锈病这样的质量性状,利用分子标记技术对目标性状进行前景选择是行之有效的,双标记选择正确率比单标记选择明显要高,并且不受田间自然发病条件的限制和人工接种技术的制约。利用在齐319与京24之间具有明显差异的42对引物进行回交群体的背景选择,已经筛选得到了背景回复率在98%以上的纯合抗病京24改良系。从10对前景引物中最终筛选出了248和337两对引物用于茎腐病抗病基因的分子标记辅助选择。研究表明,携带主效抗病基因的植株比不带主效QTL的植株抗病率明显提高36%,两个分子标记检测的结果相近,所以只选用一个即可达到目的,节省财力物力。利用在1145与京24之间具有明显差异的49对引物用于回交群体的背景选择,已经筛选得到了背景回复率在97%以上的纯合抗病京24改良系。本研究利用已获得的以京24为遗传背景分别抵抗南方锈病和茎腐病的纯合改良自交系作为亲本,在BC3F3世代对两亲本进行杂交,以达到抗病基因聚合育种的目的,现已获得了杂交的F,代材料。