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本文以大白猪、长白猪为实验材料,采用PCR-SSCP方法对猪T β-R Ⅰ(transforming growthfactot β receptor one)基因进行单核苷酸多态性的检测与分析,探讨了该基因作为影响猪产仔数性状的候选基因的可能性。
首先克隆测序获得Tβ-R Ⅰ基因第7内含子序列,对T β-RⅠ基因外显子1~7和内含子7进行了SSCP检测与分析,发现了2个单核苷酸多态性位点(SNPs),两个均为一种纯合子,一种杂合子。测序检测到两个突变位点,即:Primer 7的56位点处G-T,Primet 10的148位点处A-G。通过建立线性模型Ⅰ,估计各基因型对产仔数的影响效应。结果显示:在大白猪群体中,AB型个体的总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)都高于AA型。在长白猪中,第一胎的AB型个体的产活仔数高于从型个体,并接近显著(P<0.074),且AB型个体第一胎、二胎及以上及所有胎次的产活仔数均高于AA型个体。可以认为AB基因型相对从基因型而言,对产仔数来说是有利基因型。建立线性模型Ⅱ,将多态性位点的各种基因型组合与产仔数关系进行分析,结果表明,两个基因位点组合中,把大白猪和长白猪作为一个群体进行分析,各基因组合的总产仔数和产活仔数差异均不显著。
在单独分析大白猪时,二胎及以上的总产仔数的AACC型显著高于AACD和ABCD型(P<0.05)。在所有胎次的总产仔数的AACC型显著高于ABCD型(P<0.05),也高于AACD型,并接近于显著(P<0.081)。