霍山石斛转录组及其GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因初步研究

来源 :安徽中医药大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:honeypan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:本文旨在通过对道地药材霍山石斛多糖生物合成中的关键酶GDP-甘露糖焦磷酸化酶(GMPP)的研究,为霍山石斛多糖生物合成路径解析提供一定基础。方法:本研究以霍山石斛新鲜植株为原材料,比较优化了霍山石斛总RNA提取的方法,利用琼脂糖凝胶电泳、蛋白核酸微量定量仪及特异性PCR扩增对不同方法提取的RNA进行质量检测;通过Illumina平台进行霍山石斛的转录组测序,以了解其相关基因的表达情况,为寻找其体内合成次生代谢产物的核酸序列提供参考;针对分析结果及资料收集,实验课题选择霍山石斛GDP-甘露糖焦磷酸化酶进行基因克隆,设计特异性引物并选用Extaq酶进行PCR扩增,随后对目标基因进行电泳检测;将DNA条带从凝胶中切取下来并经琼脂糖凝胶DNA凝胶回收试剂盒处理后,用pGM-T Fast克隆试剂盒进行重组质粒构建,将包含目标基因的载体以热休克方法导入大肠杆菌DH5α中培养,培养出的菌落经PCR扩增确认后,在LB氨苄西林培养基中进行培养,培养菌群再次经PCR扩增确认目标基因后,用高纯度质粒小提试剂盒提取质粒,在确定质粒浓度后对质粒进行测序,并对获得的目标基因cDNA进行生物信息学分析;使用pDONR 221作为入门克隆进行BP反应,继之以pDEST17作为表达载体进行LR反应来构建重组蛋白表达载体;利用qPCR技术检测霍山石斛中根、茎、叶、花不同组织部位中GMPP基因的表达情况。结果:RNA提取方法优化研究结果表明MCHAN法提取的霍山石斛总RNA条带清晰,无弥散现象、完整性好且无其它杂质污染。转录组测序,构建了17个cDNA文库,初步明确了霍山石斛转录组概况,发现了7种可能参与霍山石斛多糖合成的关键酶基因,包括蔗糖酶、蔗糖合成酶、己糖激酶、磷酸葡萄糖异构酶、磷酸甘露糖异构酶、磷酸甘露糖酶与GDP-甘露糖焦磷酸化酶,为霍山石斛相关基因的克隆及验证功能提供生物信息学证据。霍山石斛GMPP基因克隆得到其cDNA序列全长1867bp,包含1245bp的开放阅读框,编码415个氨基酸;对序列分析表明霍山石斛GMPP序列与铁皮石斛、黄花石斛序列有99%相似性;进化树分析结果表明霍山石斛与铁皮石斛、黄花石斛等植物有较近的亲缘关系;通过BP和LR反应构建了霍山石斛GMPP重组表达载体,为后续诱导重组蛋白表达及重组蛋白功能验证提供基础;qPCR对霍山石斛中根、茎、叶、花不同组织部位中GMPP基因的表达情况检测结果表明GMPP基因在霍山石斛茎中表达量最高,其次是叶,然后是花,根中表达量最低,同时发现霍山石斛GMPP基因表达水平与其茎、叶、花、根中多糖含量呈高度相关性,这对研究霍山石斛多糖生物合成机理将起到积极的促进作用。结论:通过对霍山石斛RNA提取方法的优化研究得到一种简便、经济、高效的霍山石斛总RNA的提取方法,即MCHAN方法。解决了霍山石斛RNA提取的问题,为于后续转录组测序及分子克隆提供基础。通过对野生与栽培霍山石斛植株进行转录组测序,构建了17个cDNA文库,初步明确了霍山石斛转录组概况,为后续相关基因进行克隆及功能验证提供数据资料。对道地药材霍山石斛多糖生物合成中的关键酶GDP-甘露糖焦磷酸化酶的克隆及重组表达载体的构建进行初步研究,成功获得了霍山石斛GMPP体外表达载体,为下一步对重组蛋白功能活性验证提供依据。
其他文献
进入21世纪以来,中国的汽车产量从2000年的207万辆飞跃到了2009年的1379万辆。因此,汽车产业的节材、节能、减排以及降低生产成本就变成了头等大事。恰恰在这些方面,粉末冶金
互联网和云计算的快速发展,为多媒体信息的传播提供了方便,出于保护数字图像的目的,越来越多的用户将图像加密后存储在云端,云服务者会将标签信息嵌入在密文图像,对其进行分类管理。加密图像可逆信息隐藏(Reversible Data Hiding in Encrypted Image,RDH-EI)算法能兼顾上述需求,成为近年来的研究热点。本文以嵌入容量与解密图像质量为研究对象,采用异或与块置乱的加密方法
印章之制,发于夏商,盛于秦汉,但是作为一门独立的艺术——篆刻艺术,不过区区五百年左右,印章之学所做言论积淀不及于书法理论,书法之理汉朝既有体系,印章之制,宋人米元章始有
考虑一个具有脉冲效应和时滞阶段结构的Lotks-voltem模型,捕食者具有年龄结构.分析证明了模型的所有解都是一致最终有界的,并且得到了模型持续生存的充分条件.结果显示脉冲效应在
以调查问卷的方式,建立了读者满意度与满意度影响因子之间的多元线性回归模型.讨论了能够反映总体满意程度的主要影响因素.得出读者最关心的问题是馆藏资源、设施的完备性、
实验课是素质教育的重要课堂,可培养学生的动手操作能力、分析问题和解决问题的能力.本文从实验教学内容、实验教学方法的改革及提高教师的业务素质方面入手,对如何培养学生
着重论述了在我公司4102,6102系列柴油机上应用粉末冶金齿轮式机油泵的可行性及具体做法,提出了一个行之有效的降低成本的方法,不仅具有很强的实用性,而且具有一定的学术价值
在中俄双边全面战略协作伙伴关系中逐渐出现一些实质性的新特点。莫斯科和北京的领导人希望根据世界政治中的新趋势和两国提出的倡议调整双边关系。尽管遭遇西方制裁和不停的
自2003年三峡水库初期蓄水以来,水库蓄水及运行成为三峡库区涉水滑坡的主要诱发因素。三峡库区在175 m水位影响范围内共有大小滑坡两千余处,其中大于一百万方的特大型滑坡八十余个。现有的关于水库水位波动影响下的巨厚型堆积体滑坡的治理,主要采用削坡减载的方法对滑坡进行加固治理。削坡减载设计的关键在于获得既经济又安全的削坡方案,因此在确保安全的前提下削坡方案的优化就显得尤为重要。本论文以三峡库区典型动水
左手制音技巧练习要求:1、在以A自然小调音阶来练习时,请注意弹奏中各个音级的连贯性;2、右手扫弦时,一定要扫全弦,但要以发音弦为重点;3、每次只有一根弦处在发音状态,你必