为避免我国有限北极狐种群遗传多样性的流失,推动我国圈养小种群的遗传管理工作,本研究将利用微卫星分子标记,以北极狐为例,根据后代遗传质量的预测判定最佳的配对方案,为圈养小种群遗传多样性保护工作提供参考。此外,虽然微卫星标记在近缘物种间具有一定通用性,可被跨物种使用,但测试其多态性的过程非常繁琐。本研究亦将采用混合模板扩增的方法,快速简便地测试微卫星位点的多态性,为开展群体遗传学分析获得有用的微卫星标记。主要结果如下:1.用10个四碱基微卫星位点的引物,以10只北极狐的DNA为材料,分别随机抽取2个、3个、5个、8个和全部10个样品进行等量混合作为模板,扩增产物用全自动测序仪进行电泳分型。所有等位基因的电泳信号峰都清晰可辨。与单一模板扩增相比,混合模板扩增时,所有位点的复等位基因都能稳定地显示出来,不同批次试验之间的重现性达到100%。信号峰面积与等位基因频率呈线性正相关,由此可以推断待测位点的基因频率分布情况。最高信号峰与最低信号峰的面积的比值与混合样品数呈正相关,与多态信息含量呈负相关,提示混合样品的数量存在一定限度,到一定限度时低频等位基因无法检出。同时,通过这一关系,也可以推测位点的多态信息含量。2.本文共筛选出9个可用位点,全部为高度多态性位点(PIC>0.5)。除了REN54P11位点显著偏离H-W平衡(P<0.01),其他8个位点均符合H-W平衡(P>0.05)。在59只个体中共检测到48个等位基因,每个位点的等位基因数为4-7个,平均5.333个,有效等位基因数为2.280～4.290,平均为3.171个。这9个位点在该群体中的平均观测杂合度为0.695,平均期望杂合度为0.682。说明本研究群体具有较高的遗传多样性。但该群体等位基因分布不均匀,提示该北极狐饲养群体遗传多样性不稳定。3.根据本实验研究的群体的所有配对方案中每一种配对方案产生的子代在每个位点的杂合度、基因型多样性和等位基因之间的进化关系这三个指标构建后代质量指数(OQI)。发现,基因组多样性丰富且亲缘关系较远的个体配对,后代质量指数较高,说明OQI越大则配对方案越优秀。综合本研究群体中所有配对方案的亲代平均个体杂合度和多位点平均d2的平均水平推算出OQI平均水平为3.489,以此作为判定优秀配对方案的临界值。此方法可以在圈养北极狐繁殖期提供指导建议。但是具体配对方案需根据养殖场内繁殖期参与繁殖的个体的经济性状质量、发情情况和健康状况等实际情况确定。