该文采用ISSR和RAPD两种分子标记方法对东港、庄河、皮口、烟台、青岛五个地理亚群四角蛤蜊的遗传多样性、种群遗传结构进行了研究,填补国内外在四角蛤蜊研究方面的空白.结果表明:RAPD比ISSR揭示了更高的遗传多样性.两者得到的群体遗传多样性指标Na、Ne、H、I都较高,基因流水平也较高,群体间遗传分化指数G<,ST><0.5,这说明四角蛤蜊群体的遗传多样性丰富,但遗传多样性主要存在于亚群内,而不是亚群间,五个地理亚群显示出了较大的遗传相似性,这是由于基因流而造成的;通过计算五个亚群中任何两亚群之间的遗传多样性,发现任何组合的遗传多样性都很丰富,亚群之间的基因流水平也较高,遗传分化指数最大值仅为0.1461,同样说明了由于基因流的作用,亚群内的变异要远远大于亚群间的变异,而成为变异的主要方式.通过比较不同组合之间的各项指标还发现,基因流水平的高低、遗传相似性的程度和亚群之间的地理距离有关,地理位置离的越远的亚群,基因流水平越低,遗传分化指数越高,遗传相似系数越小;相反,地理距离越近的两亚群,基因流水平越高,遗传分化指数越小,遗传相似性就越大.通过ISSR和RAPD扩增反应得到的五个亚群间的遗传相似系数都很大,最小值为0.89,说明这五个亚群并没有因地理环境的差异而产生更大的分化.ISSR和RAPD得到的聚类分析图相似但不完全相同,虽然,两者都可以揭示辽宁的三个亚群亲缘关系近,山东的两个亚群亲缘关系近,但ISSR揭示,皮口和庄河在辽宁的三个亚群中的亲缘关系是最近,应该先聚到一起,而RAPD揭示东港和庄河的亲缘关系是最近的.ISSR和RAPD都揭示了在这五个亚群中,Pk亚群的遗传多样性最丰富,而Dg亚群的遗传多样性水平较低.