多重耐药铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌整合子的多样性及比较基因组学研究

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mynewgolvoe
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌是引发院内感染的重要致病菌,它们较高的耐药性是其能够在医院环境中持续存在的重要因素。这两种细菌不仅基因组本身含有各种固有的抗生素抗性机制,而且含有各种抗性相关的可移动的遗传元件。研究其耐药机制对于更好的控制临床多重耐药菌株的传播具有重要的指导意义。  本研究首先从医院临床检验科中收集铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌,共收集106株铜绿假单胞菌和39株鲍曼不动杆菌。分别检测了铜绿假单胞菌对10种抗生素的抗性,以及鲍曼不动杆菌对11种抗生素的抗性,结果表明铜绿假单胞菌对各种抗生素的抗性水平相对较低,而鲍曼不动杆菌除对多粘菌素B敏感性较高以外,对其他各种抗生素的抗性都处于较高水平。根据国际多重耐药细菌的划分标准,铜绿假单胞菌中多重耐药菌株所占比率为51.9%,鲍曼不动杆菌中多重耐药菌株所占比率为97.4%,都处于较高水平。用PCR的方法对多重耐药菌株中的1、2型整合子进行分析,结果表明多重耐药铜绿假单胞菌中1型整合子检出率为27.3%,多重耐药鲍曼不动杆菌中1型整合子检出率为60.5%,未检出2型整合子。对整合子扩增产物进行限制性酶切和测序分析,研究整合子中基因盒的排列形式,结果表明铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌中1型整合子的基因盒排列形式各有三种。在铜绿假单胞菌中,基因盒排列形式分别为aadB-aac(6)Ⅱ-blaCARB8(2.3kb)、aadB-aadA(1.5kb)和aac(6)Ⅱ-aadA13-cmlA8-oxa10(4.0kb),其中aadB-aac(6)Ⅱ-blaCARB8最为流行。这些基因盒编码的基因与氨基糖苷类抗生素、β-内酰胺类抗生素以及氯霉素的抗性相关。在鲍曼不动杆菌中,基因盒排列形式分别为aac(6)-Ⅱd-catB8-aadA1(2.3kb)、aacC1-orfP-orfQ-aadA1(2.5kb)和aacC1-orfP-orfP-orfQ-aadA1(3.0kb),其中 aac(6)-Ⅱd-catB8-aadA1最为流行。这些基因盒中包含的基因不仅编码氨基糖苷类抗生素和氯霉素的抗性,而且编码未知功能的蛋白。这些结果显示1型整合子与铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌中特定种类的抗生素抗性密切相关。为进一步研究1型整合子在基因组中所存在的遗传环境对其可移动性的影响,并从基因组的角度系统了解各种抗性机制对多重耐药表型的贡献,对一株代表性的多重耐药鲍曼不动杆菌AB16进行了全基因组的测序工作。对基因组的分析结果表明,1型整合子两端分别是转座子Tn21△和插入序列IS6100△,但是由于这两段序列不完整,可能不是促进1型整合子转移的因素,此外1型整合子两端的反向重复插入序列IS26可能是介导其转移的元件。全基因组的分析工作还揭示了基因组中的其它耐药基因和耐药元件,其中包含基因组中固有的耐药基因、外排泵基因以及耐药相关的转座子和耐药基因岛。AB16基因组中的耐药基因岛插入在一个插入热点comM基因中,由多种遗传元件镶嵌拼接而成,其中包含多重耐药基因区。耐药基因岛在不同型的鲍曼不动杆菌具有不同的框架结构,可能在不同型之间分别进化而来。
其他文献
学位
学位
目的:检测MERIT40(Mediator of Rap80 Interactions and Targeting subunit of40 kDa在三阴乳腺癌中的表达,探讨MERIT40与三阴乳腺癌临床病理因素及预后之间的关系。  方法:
据苏联《有色冶金》杂志报道,哈萨克选矿设计院研制成脉冲流氰化处理工艺。该工艺把强烈搅拌、局部分解和化学溶解矿物结合在一起。矿物的局部分解是依靠矿物相互碰撞、局部
学位
结核病是一种古老的疾病,目前仍是全世界人类健康的主要威胁之一。结核病控制有两个重要方面:一是找出传染源,切断传播途径,减少新病例的产生;二是采取有效的治疗方案,治愈病人,控
在建造和使用塑料大棚时,经常遇到将几幅薄膜拼接在一起及如何修补破损处的问题。常用的粘接方法有热合法、缝合法和粘着剂粘合法3种。 1.热合法主要用于几幅塑料薄膜粘接成
学位
学位
目的:IgA肾病(IgA nephropathy, IgAN)和膜性肾病(membranousnephropathy,MN)是两种不同形式免疫复合物沉积的原发性肾小球肾炎。探讨血管紧张素原(AGT)、血管紧张素转化酶(ACE)