番茄是世界各国广泛种植的蔬菜作物之一，也是我国的主栽蔬菜之一。但随着市场的扩展，消费者的增多，人们对番茄的品质要求也越来越高。　　 本研究采用AFLP及SSR标记，在DNA水平上研究番茄大花萼基因，建立番茄AFLP及SSR分子标记技术体系，构建与番茄MC基因紧密连锁的AFLP及SSR标记。并对48份种质资源进行筛选，以获得含有番茄MC基因的种质资源。本实验主要研究成果如下：　　 1.分析了组合08086×08085以及其有性杂交F1、F2代分离群体的田间表现，并建立了大小花萼混合池。鉴定结果表明：两个亲本间花萼性状表现差异明显，父本为08085，母本为08086，F1代为大花萼，F2代群体表现实际分离比为3.175:1，χ2检测符合3:1的分离比例。分析表明：父本08085所含的MC基因所控制的性状是由显性单基因控制的性状。　　 2.筛出4个与番茄MC基因紧密连锁的标记，其中3个AFLP标记E32M36-D、E65M63-D和E47M75-A，与MC基因的连锁距离分别为7.2cM、5.1cM、12.3cM；一个SSR标记SSR162，与MC基因的连锁距离为10.9cM。　　 3.应用获得的AFLP标记E65M63-D，以48份种质资源为试验材料，结合田间鉴定，进行AFLP标记的检测，结果表明，二者结果高度吻合，这一结果为分子育种及进一步的基因克隆奠定了基础。