基因表达谱芯片在筛选胃腺癌相关基因中的应用

来源 :第二军医大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:TomasZhang_888
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
我国是胃癌的高发区,胃癌的发病率在各种消化道恶性肿瘤中占首位,是严重危害人民健康的主要疾病之一。从分子水平了解胃癌的病因,寻找理想的胃癌分子标记,积极探索胃癌的基因治疗是进一步提高防治水平的基础与方向。全面了解胃粘膜细胞在各种条件下发生癌变过程中的基因改变,筛查胃癌相关基因,将为这些问题的解决提供可靠的线索。第一部分 利用基因表达谱芯片获取胃腺癌中差异表达的基因 目的:应用基因表达谱芯片筛选胃腺癌相关基因并对这些基因的功能进行初步分析。方法:按一步法抽提胃腺癌和对照正常胃粘膜组织的RNA并纯化mRNA;将12800种人类基因PCR产物用Cartesian Pixsys 7500点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片;将等量的对照正常胃粘膜组织和胃腺癌组织mRNA分别逆转录合成荧光分子掺入的cDNA一链做探针,混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用ScanArray 3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像,计算机分析后比较两种组织中差异表达的基因。结果:在12800条基因中,胃腺癌与对照正常胃粘膜组织间存在差异表达的基因。在所检测的5例临床标本中均存在显著差异表达的基因共27条(0.21%),其中上调的11条(0.086%),下调的16条(0.125%),下调的基因中有2条为新基因。对差异表达的基因进行初步生物学信息分析。结论:微矩阵基因芯片在筛选胃腺癌发生相关基因的改变时具有快速、高通量、高敏度等特点,胃腺癌基因差异表达谱的分析为胃癌的诊治提供了新的思路和线索。第二部分 二条胃腺癌相关基因的初步研究 目的:对二条胃腺癌相关新基因1909C01、1007G07的结构和功能进行初步研究。方法:利用National Center of Biotechnology Information(NCBI,网址http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中的核苷酸序列数据库、蛋白质序列数据库、开放阅读框分析软件等工具对1909C01和1001G07基因的全长核苷酸序列的同源性、开放阅读框和可能编码蛋白的氨基酸序列同源性进行分析,并对二条新基因的功能作出推测。结果:分析发现,1909C01有一个1323bp的阅读框,编码含440个氨基酸残基的蛋白,核苷酸序列与小鼠AK013305基因有四个较高同源性片段,与人FLB3342基因有159bp的100%的同源性片段,但序列方向相反;无同源性很高的阅读框和已知蛋白。1001G07有一个378bp的阅读框,编码含125个氨基酸残基的蛋白,核苷酸序列、开放阅读框序列和氨基酸序列与人细胞色素b5还原酶1(B5R 1)、人638号克隆InRNA均有99%的同源性。结论:100iG07基因编码蛋白可能与细胞的物质代谢密切相关,对1909C01、100iG07基因的进一步研究有助于对胃癌基因表达谱的全面理解。
其他文献
本文采用环境友好的“干涂层”法将氧化石墨水溶胶烯涂覆于棉织物表面,并经过化学-微波还原的“两步还原”法对氧化石墨烯进行还原,制备了石墨烯/棉织物柔性电极材料,进一步地采用电化学沉积的方法将金属氧化物二氧化锰沉积在石墨烯/棉织物上,制备得到了 MnO2/石墨烯/棉织物复合电极材料。旨在探索出一种制造方便,电化学性能以及稳定性良好的柔性电极制备方法。重点研究了柔性电极的电化学性能。首先,在改进Humm
为了逐步减少对化石能源的需求,加快能源转变,全球正在大力开发和利用生物质燃料。醇类燃料是常见的生物质燃料,属于清洁可再生能源,来源广、抗爆性强、燃烧温度较低,有利于降低NOx排放,因此在替代燃料以及汽车尾气的排放和控制中有着重要作用。目前有关正戊醇的基础燃烧化学实验的研究较少,导致正戊醇的化学反应机理无法得到全面的验证,所以有必要对正戊醇展开系统的化学反应机理研究。试验方面,本文利用气质联用仪(G
文化产业政策就是指将文化产业当做对象的一系列针对其而出现的政策总和。这是一个结构复杂、内容丰富的政策群,它不仅包括了在文化这个产业之上总的政策,同时也包含了其中所
汶川大地震后四川景区的恢复营销工作取得了一定的成绩,但没有达到理想效果。景区目的地形象感知作为旅游决策的归因,对游客意愿的提升起到重要作用。四川景区的恢复,需要认
<正>在实体经济供给侧结构性改革已经取得初步成效的背景下,有必要推进金融业供给侧结构性改革,减少无效、低效金融供给,增加有效、高效金融供给,提高金融供给满足实体经济金
目的:研究东兴金花茶叶的化学成分。方法:利用硅胶柱层析色谱、凝胶柱色谱、制备型高效液相色谱以及重结晶等方法进行分离纯化,通过理化性质与波谱数据鉴定化合物结构。结果:
背景与目的: Survivin是凋亡抑制蛋白(inhibitors of apoptosis protein,IAP)家族的最新成员,是一种是具有抑制细胞凋亡和调节细胞有丝分裂的双功能蛋白。X线晶体衍射证实全长
流动性风险是商业银行在经营过程中要面对的主要风险之一,也是最具破坏力的风险。农村商业银行作为我国金融系统的重要一员,在复杂的农村金融环境和激烈的区域市场竞争中,如
随着我国教育事业的迅速发展,高校科研水平的不断提升,高校实验室设备设施数量和质量也得到显著提高,其中特种设备在理工科实验室的教学科研工作、国防军工项目等方面得到广
编写教案是教学工作本身不可或缺的重要组成部分。编写过程中应注意:一是做好备课;二是确立每次课的任务;三是统一规范的格式;四是课后对教案的总结和修改。只有通过系统的学