中国环境问题,不仅关系到广大人民群众根本利益,还关系到我国国家安全和国际形象。当前,我国环保工作面临复杂局面：一方面,国家经济的快速增长和人民生活质量的不断提高对环境、资源产生更多的消耗；另一方面,发展的可持续性对环境保护提出更高的要求。因此,对潜在的环境污染事件采取自动化、电子化措施,及时发现环境污染问题,降低环境污染事件发生机率,甚至将一些重大环境污染事件杜绝于萌芽状态,已经成为当前值得探讨的重要课题。本文以污染源自动监控系统运用以及有关问题为核心,对以上所述进行思考。本论文重点对污染源自动监控系统运作方式、应用价值及相关问题进行研究。先说明选题背景意义、研究方法以及创新不足。其次,探讨环境保护与污染源监控,阐明环境保护以及污染治理间逻辑关系。随后,提出自动监控系统及其问题,亦为本论文重点研究内容。最后,对自动监控系统应用创新的环保管理体制进行探讨、对基于该系统的环保管理体制建设提出建议。本论文主要研究方法：文献法。本研究主要创新在于运用了系统思维方法,即运用了系统工程方法中的霍尔三维结构,把过程处理为逻辑维、时间维和知识维。本论文对目前的污染源自动控制系统提出了系统的思考,对包括政府、系统集成商、媒体舆论、市民等相关利益群体进行研究,同时在逻辑维、时间维和知识维(方法维)三个维度提出相关建议。同时,由于染污源自动控制系统是个比较复杂的系统工程,涉及多种利益格局,相关责、权、利关系错综复杂,通过科学的思考和分析方法,对复杂问题加以分解,从而获得优化决策的思考途径。本研究的不足在于,由于本人时间及精力有限,以及在专业深度的不足,不能深入进行系统化研究,有待下一步在工作和学习中继续提升。