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利用分子标记构建遗传图谱,进而研究物种性状的研究方法近年来发展速度很快,特别是在大豆,白菜,油菜方面的研究尤为迅速。但是,利用分子标记方法研究芜菁性状方面的记载还很匮乏,尤其是对于光信号转导方面的资料更是少见。通过借助芜菁高密度遗传图谱研究在芜菁中光对花青素合成的影响是一个有效的研究方案。开发足够数量的分子标记是构建图谱的基础,也是必要条件。鉴于目前公开报道可用的芜菁的分子标记数量有限,有必要开发更多的分子标记,为芜菁及其它芸薹属作物遗传作图和分子标记辅助育种等研究奠定基础。本研究主要开发的是芜菁SSR分了标记。以依光型花青素合成的津田芜菁和非依光型花青素合成的赤丸芜菁为试验材料,开发SSR分子标记,包括gSSR和IEST-SSR;通过多态性筛选,选出多态性较好且稳定的引物,对其多态性进行分析；克隆在两物种间有差异的SSR位点,比对序列间差异；并且分析不同来源的SSR引物的扩增结果,得到了以下主要结果：1gSSR引物的筛选及多态性分析通过GenBank公布的Brassica rapa基因组序列信息,使用MISA软件搜索SSR。结合Primer3.0设计引物,共设计合成680对符合条件的SSR引物。用设计合成的680对gSSR引物,以津田芜菁和赤丸芜菁两份自交系为试材,对合成引物进行初步的扩增分析。在开发的680对引物中,其中有565(83.1%)对引物在两种芜菁之间能够有效扩增,有多态性的引物有141对(20.7%)。通过数据分析得出gSSR的长度与其多态性水平之间没有直接线性的关系。但是,gSSR基元碱基数与重复次数和多态性水平之间存在一定的联系,即：三碱基为基元和七次重复的gSSR多态性较好。2EST-SSR的开发及SSR位点克隆：利用SSRHunter程序,对来自东北林业大学的3803条芜菁EST进行了搜索,共得到143条SSR,分布在143条EST上,占搜索EST总数的3.76%,平均9.50kb出现—个SSR,包括27种重复基元。其中,二核苷酸和三核苷酸重复类型占主导地位,共占总SSR的近97.20%。其它重复类型所占比例之和不足3%。设计合成了90对EST-SSR引物,以津田芜菁和赤丸芜菁两份自交系为试,对合成引物进行初步的扩增分析,85对引物可在两种芜菁之间能够有效扩增,占开发的EST-SSR总数的94.44%。有多态性的引物有13对,占有效扩增的EST-SSR15.3%。表明开发的EST-SSR引物在芜菁上有较好的可用性。克隆有差异的BrlEST15引物的SSR位点,比对津田芜菁和赤丸芜菁SSR序列,二者之间相差一个重复基元。3不同来源的SSR亲缘性分析根据GenBank中公布的芸薹属基因组信息和东北林业大学芜菁cDNA文库,开发了931对SSR引物,包括90对EST-SSR(?)841对gSSR。根据引物来源gSSR可分为五种,分别来自芸薹(B. rapa)(其中包括10条引物来自日本国家蔬菜与茶科学研究所),甘蓝(B. oleracea),甘蓝型油菜(B. napus),黑芥(B.nigra), EST-SSR均来自芜菁cDNA文库。通过多态性分析,得出的结论是,来自于芜菁cDNA文库的EST-SSR多态性最高,多态性比率为14.44%,其次是芸薹的SSR,多态性比率为12.12%。而来源于黑芥的SSR多态性最低,为1.77%。试验结果表明从芜菁cDNA文库和与芜菁品种亲缘关系近芸薹中开发的SSR,应用价值最大。