猪锌转运蛋白基因的克隆与组织分布

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为了研究猪锌转运蛋白在锌离子转运中的作用,本试验依据人、大鼠、小鼠和牛的锌转运蛋白基因的序列对猪的ESTs数据库和UniGene进行搜索,利用搜索的ESTs拼接序列设计引物进行RT-PCR,对猪的9个锌转运蛋白基因进行克隆,然后又对各个基因在猪的18种组织中的分布进行初探。主要结果如下:1、猪锌转运蛋白ZnT-1基因slc30A1的克隆与组织分布克隆的猪slc30A1基因包含一个完整的开放阅读框架(open reading frame, ORF),长度为1521bp,编码由506个氨基酸残基组成的ZnT-1蛋白,其中酸性氨基酸为93个,碱性氨基酸为66个,分子量为55.13 kDa,等电点为6.543。预测的信号肽区为1-29aa,成熟的ZnT-1由477个氨基酸组成。该基因在大脑、卵巢、子宫、乳腺、食道、十二指肠、空肠、盲肠、结肠、直肠、心脏、肝脏、肺脏和肌肉14种组织中有分布。2、猪锌转运蛋白ZnT-2基因slc30A2的克隆与组织分布克隆的猪slc30A2基因包含一个完整的开放阅读框架(open reading frame, ORF),长度为1044bp,编码由348个氨基酸残基组成的ZnT-2蛋白,其中酸性氨基酸为50个,碱性氨基酸为41个,分子量为37.95 kDa,等电点为6.703。该基因在卵巢、食道、盲肠、直肠、肺脏和肾脏6种组织中有分布。3、猪锌转运蛋白ZnT-3基因slc30A3的克隆与组织分布克隆的猪slc30A3基因包含一个完整的开放阅读框架(open reading frame, ORF),长度为1164bp,编码由388个氨基酸残基组成的ZnT-3蛋白,其中酸性氨基酸为49个,碱性氨基酸为42个,分子量为41.64 kDa,等电点为6.501。该基因在大脑、卵巢、子宫、乳腺、食道、盲肠、结肠、直肠、心脏、肝脏、肺脏和肾脏11种组织中有分布。4、猪锌转运蛋白ZnT-4基因slc30A4的克隆与组织分布克隆的猪slc30A4基因包含一个完整的开放阅读框架(open reading frame, ORF),长度为1287bp,编码由429个氨基酸残基组成的ZnT-4蛋白,其中酸性氨基酸为72个,碱性氨基酸为54个,分子量为47.54 kDa,等电点为6.917。该基因在卵巢、乳腺、食道、十二指肠、盲肠、心脏和肺脏7种组织中有分布。5、猪锌转运蛋白ZnT-5基因slc30A5的克隆与组织分布克隆的猪slc30A5基因包含一个完整的开放阅读框架(open reading frame, ORF),长度为2301bp,编码由767个氨基酸残基组成的ZnT-5蛋白,其中酸性氨基酸为94个,碱性氨基酸为94个,分子量为84.34 kDa,等电点为7.415。该基因在大脑、卵巢、乳腺、食道、空肠、盲肠、结肠、直肠、心脏、肝脏、肺脏和肾脏12种组织中有分布。6、猪锌转运蛋白ZnT-6基因slc30A6的克隆与组织分布克隆的猪slc30A6基因包含一个完整的开放阅读框架(open reading frame, ORF),长度为1383bp,编码由461个氨基酸残基组成的ZnT-6蛋白,其中酸性氨基酸为63个,碱性氨基酸为47个,分子量为51.04 kDa,等电点为9.275。该基因在大脑、卵巢、乳腺、食道、十二指肠、空肠、盲肠、结肠、直肠、心脏、肝脏、肺脏、肾脏和肌肉14种组织中有分布。7、猪锌转运蛋白ZnT-7基因slc30A7的克隆与组织分布克隆的猪slc30A7基因包含一个完整的开放阅读框架(open reading frame, ORF),长度为1128bp,编码由376个氨基酸残基组成的ZnT-7蛋白,其中酸性氨基酸为56个,碱性氨基酸为49个,分子量为41.54 kDa,等电点为6.943。该基因在大脑、卵巢、子宫、乳腺、食道、十二指肠、盲肠、结肠、直肠、心脏、肝脏、肺脏、肾脏和肌肉14种组织中有分布。8、猪锌转运蛋白ZnT-8基因slc30A8的克隆与组织分布克隆的猪slc30A8基因是一个突变体,克隆出的序列长度为1333bp,因突变而产生的生物学功能尚未研究。本试验仅在回肠中发现该基因有分布。9、猪锌转运蛋白ZnT-9基因slc30A9的克隆与组织分布克隆的猪slc30A9基因包含一个完整的开放阅读框架(open reading frame, ORF),长度为1698bp,编码由566个氨基酸残基组成的ZnT-9蛋白,其中酸性氨基酸为108个,碱性氨基酸为79个,分子量为63.22 kDa,等电点为8.449。该基因在大脑、卵巢、子宫、乳腺、食道、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠、直肠、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胰脏和肌肉18种组织中有分布。
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