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鲐鱼是我国近海重要的中上层鱼类资源。随着中日中韩渔业协定的生效，跨界鱼类资源渔获配额合理分配成为研究的重点，渔业资源归属的判别是研究东黄海鲐鱼的基础。为此，本文采用形态学及随机扩增多态性DNA(RAPD)分析等技术，对分布在我国东黄海海域的鲐鱼包括日本鲐(Scomber iaponicus)和澳洲鲐(Scomber australasicus)的群体差异进行比较研究，尝试从不同层面揭示群体间的差异和各自的特征，反映日本鲐不同种群间、日本鲐与澳洲鲐间的遗传背景及相互之间的关系，从而确定鲐鱼群体结构及其遗传多样性，为其渔业资源归属和捕捞配额分配提供科学依据。研究结果如下：
1.不同群体间形态学比较
根据五岛西部日本鲐(60尾)、东海西部日本鲐(60尾)和澳洲鲐(25尾)共145尾，测定20项形态学指标，即6个可量性状指标和13个框架指标，与体长相比获得19个形态学比例性状，运用差异系数检验、均数差异显著性检验、主成分分析和判别分析方法对不同群体间的形态差异进行了比较研究。
差异系数(C.D)检验表明，五岛西部与东海西部2个日本鲐种群间尚未达到亚种差异水平。
均数差异系数表明，五岛西部和东海西部的日本鲐种群间有Fl/Bl，勋，Spll/Bl，Ed/Bl、D2-4/BL，D2-5/Bl，D3-5/Bl，D4-7/Bl，D6-7/Bl等8个比例性状差异显著(P<0.05)，日本鲐与澳洲鲐间有Fl/Bl，Spll/Bl，Dl-3/Bl，D2-3/Bl，D2-4/Bl，D2-5/Bl，D3-4/Bl，D3-5/Bl，D4-5/Bl，D4-6/Bl，D4-7/Bl，D5-6/Bl，D5-7/Bl，D6-7/Bl等14个比例性状差异显著(P<0.05)。
主成分分析表明：构建四个主成分对不同群体间总变异的贡献率分别为：主成分(1)42.70％，主成分(2)10.90％，主成分(3)7.58％，主成分(4)5.92％，累计贡献率为67.09％。在第一主成分中，Fl/Bl、Spll/Bl、Spl2/Bl、Dl-2/Bl、D2-3/Bl、D2-5/Bl与D3-4/Bl的影响最大，其负荷值大于0.700；根据第一、第二主成分绘制的散布图能明显区分在形念上五岛西部与东海西部的日本鲐种群很相近，而与澳洲鲐形态差异较大； 通过建立五岛西部R本鲐、东海西部日本鲐以及澳洲鲐3群体的判别函数，判别准确率分别为：86.7％、76.7％、84.0％(P<,t>)和85.2％、82.1％、75.0％(P<,2>)，综合判别率82.1％。
2.随机扩增多态性DNA分析
从78条随机引物中筛选出31条引物，对五岛西部日本鲐、东海西部日本鲐和澳洲鲐各10个样本，进行了随机扩增多念DNA(RAPD)分析。31条引物共产生226个分子标记，分子量大小从200bp到2200bp，其中143个为多态性标记，多态百分率达到63-3％。每条引物产生的标记数从0到11不等，平均为7.29。
五岛西部日本鲐、东海西部日本鲐和澳洲鲐的群体内遗传相似度分别为：0.949、0.877、0.936，而群体间遗传距离依次为：五岛西部日本鲐-东海西部日本鲐(0.2357)<东海西部日本鲐-澳洲鲐(0.3030)<五岛西部日本鲐-澳洲鲐(0.3528)。
由UPGMA方法分析表明，五岛西部与东海西部日本鲐两种群间亲缘关系较近，而日本鲐与澳洲鲐差异较大。
Shannon多样性表明，其遗传多样性大小依次为：东海西部日本鲐>澳洲鲐>五岛西部日本鲐。