肾细胞癌临床指南多层次知识建模与图谱化表示研究

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临床指南作为循证医学和临床实践的纽带,在规范医疗行为、提高医疗质量等方面均发挥了重要作用。肾细胞癌是泌尿系统常见恶性肿瘤,相比于其他类型肿瘤疾病,面向肾细胞癌的治疗药物涌现速度更快,为此各国家和地区不断制定、修订肾细胞癌临床指南。但调研发现,以文本形式发布、使用和交流,利用自然语言阐述病症表现、诊疗流程的临床指南并没有很好地推广、应用于临床实践,亟需将其转化为结构化、知识化和形式化的表示形式,辅助临床医护人员学习指南内容与知识,明晰指南更新、变化情况。针对肾细胞癌临床指南查阅费时、更新频繁等现状,以及临床医生学习、利用指南知识,梳理指南更新内容的迫切需求,本研究基于肾细胞癌疾病特点和肾细胞癌临床指南特点,提出并构建肾细胞癌临床指南多层次知识模型,设计肾细胞癌临床指南的图谱化表示与版本比对方法,最后通过开发肾细胞癌临床指南结构化与图谱化原型系统,对模型科学性和方法有效性进行验证与评估。具体来说,本研究的主要内容包括以下三部分:(1)完成了肾细胞癌临床指南多层次知识模型构建。详细剖析了肾细胞癌的病理、诊疗特点,以及肾细胞癌临床指南的格式、结构、内容和语言特点,聚焦于丰富肾细胞癌临床指南内容揭示的粒度和维度,设计、构建肾细胞癌临床指南多层次知识模型,利用模型中的文档层、模块层和知识层从不同维度和粒度对肾细胞癌临床指南知识进行组织。(2)设计了肾细胞癌临床指南图谱化表示与版本比对实现方法。首先对肾细胞癌临床指南PDF文档进行解析并转储为易于处理的文件格式,基于多层次知识模型模块层组织架构,实现指南内容的分层梳理与结构化;然后对结构化后获取的指南模块内容进行预处理,利用知识模型知识层,结合NCIt、UMLS词典和自设规则库进行信息抽取,并将抽取出的实体、关系以及属性存储入图形数据库中,进行图谱化表示;最后,在引入指南更新说明进行指南更新内容识别的基础上,设计指南更新内容发现和知识特征差异辨析方法,标识出指南中的新增、删除或修改的内容,以及存在差异的实体、等级、数量和时间知识特征。(3)开发了临床指南结构化与图谱化原型系统。结合临床指南应用现状及临床医生的实际需求,利用肾细胞癌临床指南多层次知识模型和肾细胞癌临床指南图谱化表示与版本比对方法,设计并开发了肾细胞癌临床指南结构化与图谱化原型系统,提供指南层级结构浏览、版本比对、更新时序展示等功能,结合定量评估和专家评估结果,验证了本研究的科学性、合理性和实用性。
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