本文采用野外调查及室内实验生态的方法研究了惠阳大亚湾海水网箱养殖区生态系统中碳、氮、硫、磷、钙、镁、铁、锌、铜、钼、硒、锶的分配与流动特征。分别测定饵料、养殖鱼类、网箱附着生物群落、海水、微生物、底栖生物、底泥中的元素分配及估算了流动速率，同时，在实验室测定了海水网箱养殖过程中自身污染物的形式与数量。不同种类的饵料、不同体重的饵料鱼中各组织的元素含量都会有差异。其中，各种饵料以及饵料鱼各组织的碳含量为215-483 mg／g，氮含量为52-133 mg／g，磷含量为8-80 mg／g，钙含量为2-154 mg／g。测定了卵形鲳鲹、不同性别的花尾胡椒鲷、不同体重的斜带石斑鱼以及这些鱼不同器官组织的碳、氮、硫、磷、钙、镁、铁、锌、铜、钼、硒、锶元素含量。这三种鱼所含的碳、氮、磷、钙平均为447.5mg／g、110.8mg／g、24.3 mg／g、38.7mg／g。种类、性别、体重影响了网箱养殖鱼类各器官组织的元素含量。在附着生物中，贻贝与牡蛎所占的生物量最大。经估算，养殖区附着生物群落所含的碳、氮、磷、钙分别为7.8×10⁶g、9.0×10⁵ g、6.8×10⁴ g、1.3×10⁷ g。测定了惠阳海水网箱养殖区及附近海域海水中氮、磷、钙、镁、铁、锌、锶等元素的时空变化。海水网箱养殖区海水中的氮、磷、钙含量分别为0.013-0.032mg／L、0.0048-0.0220 mg／L、64-180 mg／l。网箱养殖过程对养殖区海水元素含量产生显著影响，养殖区的氮、磷含量比非养殖区高（P＜0.05），而钙、锶含量比非养殖区低（P＜0.05）。设计了平板计数法与生物量一菌落标准曲线结合的实验方案，测定海水中细菌与真菌的生物量，分析菌体中碳、氮、硫、磷、钙、镁、铁、锌、铜、钼、硒、锶元素的含量。养殖区中细菌与真菌的生物量分别为5.4×10^-4 mg／L、6.3×10^-5mg／L，细菌中所氮、磷、钙含量分别为78 mg／g、7.2 mg／g、41 mg／g。测定了惠阳海水网箱养殖区及附近海域底泥中碳、氮、硫、磷、钙、镁、铁、锌、铜、钼、硒、锶元素含量的时空变化，并分析了大型底栖生物的现存量与元素含量。养殖区底泥的碳、磷、钙、铜、锶含量高于非养殖区。养殖区底泥中的碳、钙含量分别14.8g／（L底泥）、30.6 g／（L底泥）。大型底栖生物中，贝类的生物量最高。养殖区大型底栖生物中的碳、钙分别为25.2 g／（L底泥）、43.7g／L底泥)。养殖过程中以饵料鱼投喂养殖动物产生的氮、磷、能量负荷以残饵、粪便、排尿、脱落物等形式存在，其中残饵分为骨、软组织、鳞，它们的元素含量有较大的差别。在不断接受投饵的海水网箱养殖生态系统中，各种元素在网箱、海水、底泥之间及养殖生态系统内外之间流动。惠阳大亚湾海水网箱养殖生态系统中的氮与磷不断向系统外输出。养殖区中存在象泵一样的机制，把钙从附近海区的海水中“泵”入养殖区，再“泵”入养殖区海底。