疾病是人和人类社会都必须面对的问题。秦汉时期对疾病已经有了较深入的认识,不仅对于寄生虫、癌症等复杂的病症有所了解,且出现了麻醉和手术的疗法。医学理论方面,秦汉时期初步具备将疾病分类的思想,并且在实践中不断调整对疾病的命名和分类方式。疾病的诊疗深受社会观念的影响。秦汉时期人们对疾病的认识既有理性的一面,又有迷信和反科学的一面。战国后期,阴阳五行学说基本定型,成为了中医的理论支撑,医家以阴阳五行学说来解释疾病的产生,指导疾病的治疗,显示出对疾病理性认识的一面。然而鬼神观念的盛行使人们将鬼神作祟视为疾病产生的重要原因,并且将占卜和驱鬼的巫术、仪式视为诊疗疾病的重要方法;此外,方术在疾病的诊疗中也占据着重要地位,占卜、日书等经常用于判断疾病的成因以及发展趋势,显示出人们对疾病认识的迷信和反科学的一面。疾病观念也影响着秦汉社会观念。受到中医身体观的影响,秦汉时期的学者将“天人相参”的身体观发展为“天人一体”,视人体为与宇宙沟通的小宇宙,由此导致了对身体的极度敬畏,也加重了秦汉的“厚葬”之风。疾病对政治也有重大影响。秦汉的学者用医理阐释政治学说和政治主张,增强其理论的说服力;疫疾的流行也往往带来巨大的人口和经济损失,迫使统治者调整政策;在政治斗争中,政治人物将疾病作为表达政治立场、攫取政治利益、避免政治风险的手段。疾病观念和秦汉社会之间是一种相互塑造的关系。