糯玉米起源于中国或东南亚,是玉米属玉米种的一个亚种。玉米地方品种是我国重要的玉米种质资源,它们往往对地方环境的适应性强,具有一些特异的适应性状。在目前我国收集的糥玉米地方种质资源中,79.55%的来源于西南地区,但是这些糯玉米地方品种大多数无系谱记录,亲缘关系模糊不清,育种利用比较困难。研究和分析这些糯玉米地方品种的遗传多样性与亲缘关系,对于糯玉米种质的利用具有重要意义。本研究采取混合取样策略,利用荧光标记SSR技术,对来源于我国7个省份的90份糯玉米地方品种和6个标准测验种自交系基因组的31个简单序列重复(SSR)位点进行分析。在90份糯玉米地方品种中,共检测到216个等位变异,每个位点检测出2-12个不等,平均等位基因6.97个,多态性信息量(PIC)为0.67,标记指数(MI)为4.92。研究发现,供试糯玉米地方品种的遗传组成较为丰富,不同地理来源的糯玉米地方品种都存在丰富的遗传多样性。其中,广西和贵州的糯玉米地方品种的遗传多样性相对更为丰富,是重要的糯玉米遗传多样性中心。经过对90份糯玉米地方品种与标准测验种自交系比较,糯玉米地方品种内存在大量的特异等位基因。90份糯玉米地方品种可初步划为3个类群。每个类群均包含中国6个地区的糯玉米地方品种和1-3个标准测验种自交系。本研究分析了供试糯玉米品种的类群,建立了糯玉米地方品种与标准测验种之间的对应关系,为这些材料的育种与生产应用奠定了理论基础。