中国人TNFSF15基因多态性与克罗恩病相关性研究

来源 :浙江大学医学院 浙江大学医学部 浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:guhiayan123
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炎症性肠病(Inflammatory Bowel Disease, IBD)包括克罗恩氏病(Crohn’s Disease, CD)和溃疡性结肠炎(Ulcerative Colitis, UC),是一类慢性非特异性肠道炎症。其中CD是一种慢性肉芽肿性炎症,病变以回肠末端及其邻近结肠为主。CD的临床表现是腹痛、腹泻、腹块,体重减轻、营养不良等。其病因和发病机制目前尚不明确,可能与三方面的综合作用有关:肠道菌群,异常免疫介导的组织损伤和遗传易感性。2001年NOD2/CARD15基因被确定为CD的首个遗传易感基因。CD(20%-50%VS 0%-7%)及UC(14%-19%VS 0%-5%)患者,单卵双胎共患率显著高于双卵双胎共患率,表明遗传因素在IBD发病机制中有重要性作用。近年来,多项研究显示VDR基因、STAT6基因,HLA基因,CTLA-4基因,ICAM-1基因,NAT2基因及TLRs基因等IBD连锁基因与IBD的发病有密切关系,但存在着种族和地区的差异。2005年,日本学者第一次对CD患者做了全基因组的80,000单核苷酸多态性(SNPs)检测,发现TNFSF15(Tumor necrosis factor superfamily,member 15)的SNPs基因型与日本及欧洲人种的CD易感性均有显著相关性,这在随后的研究中也多次被证实,但中国汉族CD患者与TNFSF15的相关性如何未见报道,本研究主要探讨TNFSF15与中国汉族人CD的关系。方法收集中国汉族人确诊CD患者和健康者,采集外周静脉血并提取DNA,设计TNFSF15三个多态性位点rs3810936, rs6478109, rs7848647的目的基因片段的特异性引物,并应用PCR方法扩增DNA样本中的目的基因片段,对扩增的目的基因片段进行测序,用SPSS13.0统计软件分析等位基因的多态性与疾病易感性及与疾病亚型之间的关系。结果本研究有42例中国汉族CD病人及49例健康对照入选,使用SPSS13.0统计软件对数据进行分析,发现,CD组和健康对照组rs3810936位点的等位基因携带频率分别为35.7%和44.9%,(χ2=1.581,P=0.209);rs6478109位点的等位基因携带频率分别为38.1%和43.9%, (χ2=0.624,P=0.429),rs7848647位点的等位基因携带频率分别为38.1%和44.9%, (χ2=0.861,P=0.354),三个位点等位基因携带频率两组比较无显著统计学差异。在CD组和健康对照组中rs3810936位点的CC,CT及TT基因型频率分别为45.2%,38.1%,16.7%和30.6%,49.0%,20.4%,CD组和健康对照组中rs3810936位点CC与TT基因型相比的aOR值为1.810(95%CI 0.556-5.886,P=0.324),CC及CT基因型相比的aOR值为1.900(95%CI0.752-4.799,P=0.175),TT及CT基因型相比的aOR值为0.952(95%CI 0.300-3.022,P=0.934);CD组和健康对照组中rs6478109位点的GG,GA及AA基因型频率分别为42.9%,38.1%,19.0%和30.6%,51.0%,18.4%, rs6478109位点GG与AA基因型相比的aOR值为0.741(95%CI 0.229-2.394,P=0.616),GG及GA基因型相比的aOR值为0.53(95%CI 0.211-1.351,P=0.185),AA及GA基因型相比的aOR值为1.389(95%CI 1.444-4.345,P=0.572);CD组和健康对照组中rs7848647位点的CC,CT及TT基因型频率分别为42.9%,38.1%,19.0%和30.6%,49.0%,20.4%, rs7848647位点CC与TT基因型相比的aOR值为1.500 (95%CI0.473-4.761,P=0.491),CC及CT基因型相比的aOR值为1.800(95%CI 0.708-4.574,P=0.217),TT及CT基因型相比的aOR值为0.833(95%CI 0.271-2.566,P=0.751);本研究还分析了三个SNPs位点组成的亚型,亚型B1 (cc-gg-cc)即包含三个危险等位基因的亚型,与健康对照组相比,其亚型频率分别为38.1%和26.5%(P>0.05),而亚型Ai (tt-aa-tt)即包含三个保护等位基因的亚型,与健康对照组相比亚型频率为14.3%和12.2%(P>0.05),也无明显保护作用。并且根据多因素回归分析在中国汉族人CD的临床分型,吸烟与否,性别,上消化道及肛周累计情况上,这三个位点的SNPs在CD组与健康对照组中相比无明显统计学差异(P>0.05)。结论1、本研究发现TNFSF15的rs3810936, rs6478109, rs7848647的SNPs与中国汉族人CD无明显相关性。2、TNFSF15的rs3810936, rs6478109, rs7848647的SNPs与中国汉族人CD的临床亚型间也无明显相关性。3、TNFSF15基因rs3810936, rs6478109, rs7848647的SNPs可能存在种族及地域差异。
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