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杏为核果类果树，原产于中国，种质资源十分丰富。对包括杏在内的果树品种品系鉴定多采用形态学、孢粉学和生理生化等方法，近年来分子标记技术的诞生，相继有采用RAPD方法对杏种质资源研究的一些报道，而其他分子标记方法如ISSR、SSR对杏种质资源进行分析的报道还寥寥无几。本研究为《杏种质资源亲缘关系及分类地位的ISSR和SSR分子标记研究》，旨在从DNA水平上，对30份杏品种资源及主要种基因组DNA进行ISSR、SSR分析，研究杏种、品种之间的亲缘关系和分类地位，并建立主要杏种、品种的DNA指纹图谱，进行品种品系的鉴定，为品种审定、保护奠定基础；同时对仁用杏品系的起源问题进行探索。试验得出以下结论：（1）杏属植物ISSR优化反应体系：总体积20μl时，DNA模板量200ng；引物浓度0.2μM，10×buffer（20mM MgSO4，100mMKCl，80mM（NH4）SO4，100mMTris-HCl，0.5％NP-40，pH9.0）2μl，dNTP 200μM，Taq聚合酶2U，最佳退火温度52℃。（2）SSR标记可在不同种甚至不同属之间有通用性。本试验从桃和樱桃上开发的108对SSR引物中筛选出22对引物：BPPCT009、BPPCT020、BPPCT022、BPPCT033、BPPCT040、CPPCT6、CPPCT7、CPPCT8、CPPCT10、CPPCT14、CPPCT15、CPPCT16、CPPCT28、CPPCT30、CPPCT31、UDP96-010、UDP96-015、UDP96-019、UDP94-402、UDP98-406、UDP98-408、PS08E08。这些引物可直接应用于杏种、品种间的SSR分析。（3）30份杏属植物材料的ISSR、SSR标记研究，采用了聚类分析和主坐标分析两种方法。ISSR标记结果分析：聚类结果将所用杏属植物的试材大致划分为9大组：组Ⅰ为普通杏的所有品种和一个西伯利亚的品种红花山杏；组Ⅱ为藏杏单独归为一组；组Ⅲ为所有的仁用杏品种：组Ⅳ为西伯利亚杏的品种包括西伯利亚杏、大山杏、辽梅；组Ⅴ为辽杏单独划为一组；组Ⅵ为李梅杏的一个品种红梅杏；组Ⅶ为紫杏；组Ⅷ为李梅杏的品种包括泰安杏梅、李蜜杏、昌黎杏梅；组Ⅸ为梅杏杂交种送春单独为一组。主坐标分析结果将30份供试材料明显的划分为三组，其中仁用杏系品种在坐标图中分布区域比较密集，划为一组；李梅杏的几个品种、紫杏、送春分布到一个区域中，将其划为一组；普通杏、西伯利亚杏、辽杏、藏杏聚集在一个区域，将其划为一组。SSR标记结果分析：聚类结果将所用杏属植物的试材大致划分为9大组：组Ⅰ为普通杏的4个品种骆驼黄、华县接杏、陕梅杏、串枝红及一个仁用杏品种80D05；组Ⅱ为西伯利亚杏的所有品种和仁用杏除80D05在外的所有品种；组Ⅲ为辽杏单独划为一类；组Ⅳ为一个普通杏品种克孜克西米西和藏杏聚在了一起；组Ⅴ为李梅杏的一个品种红梅杏；组Ⅵ为梅杏杂交种送春；组Ⅶ为泰安杏梅、李蜜杏，是李梅杏的两个品种；组Ⅷ为昌黎杏梅亦属于李梅杏；组Ⅸ为紫杏，是单独的一个种。主坐标分析结果显示，普通杏、西伯利亚杏、辽杏、藏杏的所有代表品种聚集在第一象限，与ISSR的主坐标分析不同的是，一个李梅杏品种红梅杏（14）亦聚在了这里；13个仁用杏品种的分布情况是由第一象限逐渐过渡到第二象限，其中3个仁用杏品种分布在上述品种的周围，而6个仁用杏品种则完全分布在第二象限，其余仁用杏品种介于二者之间；李梅杏品种泰安杏梅（15）、李蜜杏（16）昌黎杏梅（17）及紫杏、送春聚集在第三象限。（4）SSR标记聚类分析显示，供试材料油仁对丰仁的遗传距离为0，在DNA分子水平上看，二者为同物异名。（5）C210-5是从龙王帽中经过营养系选择的方法得到的品种，试验通过SSR-PCR的方法，证明了C210-5可以作为一个单独的品种进行品种命名。（6）仁用杏的起源聚类结果认为：ISSR方法与普通杏的亲缘关系较近；SSR方法与西伯利亚杏的亲缘关系较近。主坐标分析结果大多数都偏离普通杏种群和西伯利亚种群，因此，仁用杏群体的起源还需进一步试验的深入研究。