背景肠道微生态改变与多种肝脏疾病的发生发展密切相关。虽然间充质干细胞移植治疗急性肝损伤的机制已被广泛研究,但该过程中肠道微生态的变化目前尚未报道。方法间充质干细胞经尾静脉注射治疗四氯化碳所致肝损伤小鼠。通过观察生存曲线、肝生化指标和肝脏病理等评价治疗效果。利用实时荧光定量PCR技术和免疫荧光染色技术评价ZO-1蛋白的表达和分布,并用透射电子显微镜观察紧密连接的超微结构。基于16S rRNA基因测序技术分析盲肠结肠内容物肠道微生态的改变。结果间充质干细胞移植后显著降低了肝损伤小鼠血清谷丙转氨酶和谷草转氨酶的水平,改善了肝脏组织病理,并提高了小鼠生存率。与肝损伤组相比,治疗组第2天表现为ZO-1的表达升高和连续性分布以及紧密连接的完整;第7和14天两组ZO-1表达和分布无显著差异。治疗组肠道微生态改变具体表现为:第2天拟杆菌门S24-7、Bacteroidaceae科丰度减低,而厚壁菌门 Dehalobacterium、Lactobacillus属丰度增加;第7天 Dehalobacterium、Oscillospira属丰度增加;第14天无特征菌属变化。此外,基于Greengenes数据库通过PICRUSt功能预测发现治疗组早期特征性富集细胞动力、信号转导和膜转运等相关功能基因。结论间充质干细胞移植后,肠道微生态发生显著改变,这些改变通过促进肠粘膜结构完整、维持肠内环境稳态从而促进肝脏修复。