随着大数据、云计算等数字技术的高速发展,个人信息的有序利用和权利保护成为社会公众的关注焦点和学术界重点研讨的论题。新型冠状病毒肺炎疫情作为我国极具代表性的重大突发公共卫生事件,其个人信息保护实践为完善我国个人信息保护制度提供了全新观察视角。新冠肺炎疫情防控期间,个人信息在疫情预警预判、重点人群流动监测等方面充分发挥优势,地方政府等个人信息收集主体为优先保护公共利益,采用健康码、电子通行证等线上抗疫应用程序和线下多渠道相结合的方式广泛收集、使用公民个人信息,在有效遏制新冠肺炎疫情的同时亦引发了公民个人信息泄露、行踪轨迹曝光等“次生灾害”。相对于常规状态下,突发公共卫生事件中的个人信息兼具多重价值和利益关系,合理平衡应急管理下的个人信息使用与保护之间的关系是强化突发公共卫生事件中个人信息保护的关键所在。目前,《个人信息保护法（草案）》正向社会各界公开征求意见,在此契机下系统研究突发公共卫生事件中个人信息行政法保护势在必行。基于新冠肺炎疫情防控实践研究突发公共卫生事件中的个人信息行政法保护极具现实意义和应用价值。为明确突发公共卫生事件中收集、使用个人信息的边界,以界定突发公共卫生事件和个人信息为出发点阐述了突发公共卫生事件中个人信息保护的基本原则,通过分析突发公共卫生事件中行政应急管理与个人信息保护的利益博弈,提出在突发公共卫生事件中应当遵循公共利益优先、兼顾保护个人信息权益。坚持问题导向,以新冠肺炎疫情防控为视角分析了我国突发公共卫生事件中个人信息保护的现状及问题,如个人信息收集主体及其权责模糊、个人信息收集边界不明、个人信息处理环节亟待规制及个人信息保护行政监管和救济力度不够等。我国突发公共卫生事件中个人信息保护应立足现实国情,从明确突发公共卫生事件中个人信息收集主体范围及其权责、加强对个人信息的分级分类保护、完善个人信息处理规则并规范突发公共卫生事件中个人信息保护行政监管和救济方式四个方面解难纾困。