本研究结合ISSR和传统的形态分类学对湖南大戟科野桐属的12个种（南平野桐，毛桐，东南野桐，崖豆藤野桐，杠香藤，粗糠柴，白背叶，红叶野桐，小果野桐，野桐，野梧桐，桃源野桐），以及假奓包叶（Discocleidion rufescens）和山麻杆（Alchornea hunanensis）的亲缘关系进行了分析。 本研究采用了CTAB法2提取各物种的植物基因组DNA，并对ISSR反应程序中的一些重要参数进行摸索和优化，建立了稳定的、适用于湖南大戟科野桐属遗传多样性和遗传分化研究的ISSR-PCR反应体系。经过优化后的反应体系为：10μlPCR体系中，0.5U TaqDNA聚合酶，0.2μmol/L引物，0.2mmol/L dNTPs，1.5mmol/LMgCl2，10ng模板DNA。最佳扩增条件为：1)预变性：94℃，1.5分钟；2)变性：94℃，45秒；3)退火：52℃-55℃，45秒；4)延伸：72℃，1.5分钟；共35个循环后，最后延伸7分钟。 本研究用POPGENE软件对14个种进行了多态性比较和聚类分析，研究结果表明：1)野桐属具有相对较高的遗传多样性水平，这与其广泛的地理分布相符；2)作为参照的假奓包叶（Discocleidion rufescens）和山麻杆（Alchornea hunanensis）与野桐属（Mallotus）的12个种在遗传距离相差甚远，这与经典分类学的结果吻合；3)本研究聚类结果将崖豆藤野桐、杠香藤、粗糠柴聚在同一大类上是合理的；4)野桐与野梧桐不应合二为一，还是作为独立的种为好；5)桃源野桐是一新种，并非红叶野桐居群内部自然杂交产生的，且它与小果野桐的亲缘关系最近。此外，桃源野桐是否可另立一新组——桃源野桐组，还须通过实验进一步验证。