我国经济高速发展的同时也引发严重的资源环境问题,发展方式迫切需要绿色转型。而区域绿色创新发展是绿色发展的动力。有效发挥专利行政执法优势来激励区域绿色创新发展,促进经济绿色发展转型尤为重要。然而,目前几乎没有关于专利行政执法与区域绿色创新发展的关系直接研究成果,相关研究多集中在知识产权保护对区域绿色创新发展的影响研究,研究内容也较为宽泛,不能满足推动绿色发展需求。因此,本文基于相关理论基础和现有研究成果,深入探讨专利行政执法与区域绿色创新发展的关系,从而为我国有效运用专利行政执法优势来提高区域绿色创新发展提供参考。在文章结构安排上,首先在现有文献的基础上测算专利行政执法强度,运用Malmquist-DEA方法测区域绿色创新发展指数,并从现实角度分析了专利行政执法与区域绿色创新发展现状,以散点图表形式初步验证专利行政执法与区域绿色创新发展之间的关系。其次,以马克思的生态思想与绿色发展理论和马克思创新发展理论、中国特色知识产权保护的经济学基础理论以及西方绿色发展理论和制度经济学理论结合前沿文献研究范式,分析专利行政执法对区域绿色创新发展的作用机制和影响路径,并相应提出理论假设。最后,本文选取2009-2017年我国省域面板数据,利用中介效应和调节效应模型实证检验专利行政执法对区域绿色创新发展的影响路径。研究结果表明:第一,专利行政执法对区域绿色R＆D投入高度正相关;在专利行政执法的影响下,区域绿色R＆D投入对区域绿色创新发展起促进作用。第二,专利行政执法不是直接作用于区域绿色创新发展,而是分别通过技术市场发展和区域绿色R＆D投入的中介作用对区域绿色创新发展发挥正向作用,并且通过环境规制调节作用促进区域绿色R＆D投入,从而正向影响区域绿色创新发展。第三,专利行政执法在当年至滞后3年四年数据中通过促进技术市场发展正向影响区域绿色创新发展;专利行政执法通过推动区域绿色R＆D投入增加在滞后3年数据中正向影响区域绿色创新发展;专利行政执法在滞后2年和滞后3年四年数据基于环境规制对区域绿色R＆D投入和区域绿色创新发展关系产生正向影响。因此,政府应完善并强化专利行政执法相关工作,充分发挥专利行政执法中行政查处的主动性职能;各级政府要制定长期区域绿色创新发展战略,各类企业要有长远的绿色可持续发展眼光;相关部门应重视技术市场和区域绿色R＆D投入的中介地位以及环境规制的调节作用。