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镰孢菌是重要的植物病原真菌之一,可引起多种植物发生病害。本研究以供试的尖镰孢菌菌株为研究对象,利用生物信息学方法分析尖镰孢菌全基因组SSR位点的分布特点,在此基础上开发SSR引物用来分析尖镰孢种内的SSR遗传多样性;以山西不同地区采集的镰孢菌株为研究对象,采用线粒体小亚基(mtSSUrDNA)和组蛋白H3(histone H3)两个基因序列探讨不同种的镰孢菌的系统发育关系。其主要研究结果如下:1.对7条已公布的尖镰孢菌染色体基因组序列进行生物信息学分析,结果表明:基因组中7条染色体共有860个SSR位点,平均每条染色体出现122个SSR位点,大约每44.2kb出现一个长度不小于18bp的SSR位点。其中四、五核苷酸重复为主要重复类型,占全部SSR的比例分别为23.84%和32.56%;435种重复基元的分布情况存在差异,基元为ACAA/TTGT出现次数最多,为33次,其次为CAAA/TTTG,出现32次。说明尖镰抱菌基因组中含有丰富的SSR位点,为Genomic-SSR标记在尖镰孢菌鉴别中的应用奠定了理论基础。2.采用SSR分子标记技术对尖镰孢菌进行遗传多样性分析,结果表明,60对SSR引物中有11对引物多态性较好;11对引物共扩增出39条多态性条带,平均每对引物扩增3.6条多态性条带,多态性位点比例高达100%;各个菌株间的遗传相似系数在0.436-0.949,平均为0.662,当相似系数为0.95时,21株供试菌株全部分开。结果显示,基于全基因组的SSR标记具有丰富的多态性,可用于尖镰孢菌的遗传多样性分析。3.采用镰孢菌mtSSUrDNA和histone H3两个基因片段的两对引物进行试验,结果表明,供试菌株均可扩增出长约657bp左右的mtSSU rDNA序列和489bp左右的histone H3序列。mtSSUrDNA和Histone H3基因片段构建的系统进化树中供试菌株分别分为5种和6种类群,但histone H3基因片段构建的系统进化树中6种类群下又有许多分支种内分化更明显。说明histoneH3基因序列比mtSSU rDNA基因序列更富于变化。mtSSU rDNA和histone H3序列系统发育分析可为镰孢菌属的进化关系提供可靠依据。4.基于mtSSU rDNA和histone H3联合基因构建系统发育树,结果得到1201bp的mtSSUrDNA+histoneH3合并数据集,所有供试菌株被分为5个类群,每种类群下分化十分明显。联合基因建树能降低不同基因间进化速率差异对系统发育树的影响,分析结果更准确。