非营利组织在我国经济发展过程中的影响逐渐广泛，它发挥着与政府同样的为社会服务的职能，但却有别于政府组织，它是更能够贴近社会的公益性团体。通过提高非营利组织的运营效率以及改善经营管理，可以更大程度上发挥该组织的社会效用。但是随着社会的多元化发展，非营利组织在经营管理方面频繁出现严重的漏洞，这些问题严重危及组织在社会上的公信力，也引发了社会对于非营利组织内部控制现状的质疑。财政部分别于2008年和2010年分别出台的《企业内部控制基本规范》和《企业内部控制配套指引》，为企业内部控制体系的建设提供了科学的引导，是内部控制理论发展的里程碑。内部控制理论在企业中的应用能够为非营利组织内部控制的改善提供理论基础，同时我们借鉴国外对于非营利组织管理方面的经验，这将为我国非营利组织内部控制的研究提供实践参考。本文以企业内部控制的理论为基础，并结合非营利组织自身的特点，总结当前非营利组织内部控制存在的问题。由于中国红十字会在我国影响比较广泛，所以以中国红十字会为例，提出进一步完善非营利组织内部控制的基本措施。本文引用大量比较有社会争议的案例，并进行总结归纳，从内部控制五个要素方面披露非营利组织内部控制方面存在的典型的缺陷。在对非营利组织内部控制改进和完善的方面进行阐述时，本文以红十字会为例加以阐述，提出一系列具有普遍适用性的政策，这将对于非营利组织内部控制的完善起到借鉴作用。本文的创新点主要体现在两个方面，首先，本文在阐述非营利组织内部控制缺陷时，结合大量的案例研究，尤其是对红十字会组织的案例进行剖析，使研究更具有针对性；其次，本文采用一系列的流程图，将理论与图示结合起来进行阐述，更有利于读者理解。