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该文首先回顾了微卫星分子标记的发展简史、并介绍了微卫星的特点、分析方法、制备方法及其在水产业上的应用,然后介绍了用经典的分子生物学方法筛选方正银鲫(Carassius auratus gibelio(Block))、南美白对虾(Penaeus vannamei)、栉孔扇贝(Chlamys farreri)的微卫星序列,并对这些序列设计了引物.首先采用酚/仿抽提的方法提取方正银鲫、南美白对虾、栉孔扇贝的基因组DNA,然后应用DNA重组技术构建小片段部分基因组文库.采用人工合成并用放射性同位素<32>p标记的探针(CA)<,15>和(CA)<,15>、(AT)<,12>、(AG)<,12>、(AAT)<,8>、(AAG)<,8>分别构建的方正银鲫、南美白对虾和栉孔扇贝基因组文库进行筛选并测序,分别获得了130、152、29个微卫星序列.其中方正银鲫和南美白对虾的完美型、非完美型、混合型分别占64.3％、16.9％、18.8％和61.5％、13.9％、24.6％.应用麻省理工学院的网上primer3软件对三种动物筛选的微卫星序列引物设计,共设计104、105、8对引物.在该实验中得出方正银鲫基因组除(CA)n重复序列外,在di-核苷酸重复序列(AT)n的含量也很大,其次为(AG)n、(CG)n.另外,在该实验中发现在南美白对虾中由di-核苷酸重复序列组成的微卫星序列,(AG)n微卫星序列含量最多,其次为(AC)n、(AT)n,这一结果与其它学者得出的结果不同.