一组克雷伯菌属菌的耐药表型与基因型研究

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目的:研究一组克雷伯菌属菌的耐药表型、基因型、耐药基因与可移动遗传元件的相关性以及耐药菌株之间的亲缘性。  方法:  (1)2009年8月~2011年3月间,来自痰标本的20株克雷伯属菌采用法国梅里埃公司API20 E系统初步鉴定菌种,并进行菌种的基因鉴定;  (2)采用K-B纸片扩散法检测20株克雷伯属菌对15种抗菌药物的敏感性,并根据2010年美国CLSI的标准进行抗菌药物敏感性判断;  (3)提取细菌 DNA后,基因检测的模板液,-20℃冰箱保存备用;  (4)全部基因(β-内酰胺酶基因、氨基糖苷类修饰酶基因、16SrRNA甲基化酶基因、喹诺酮类耐药基因、13种可移动遗传元件、利福平类药物与消毒剂类获得性耐药基因、外膜孔蛋白基因)检测均为PCR法,检测试剂盒以及阳性对照DNA均由无锡市克隆遗传技术研究所提供,完全按照试剂盒说明书操作;  (5)对PCR阳性产物进行测序,并对测序结果用Chromas软件直接作BLAST Search比对;  (6)对获得性耐药基因和可移动遗传元件标记基因检测的结果作指标聚类分析(非加权配对法,UPGMA);(7)对管家基因和水平转移基因的检测结果作样本聚类分析(Neighbor- Joining法)。  结果:  (1)本组菌株经鉴定,2株为植生克雷伯菌,18株为肺炎克雷伯菌;  (2)本组菌珠对15种抗菌药物的耐药率为35%~100%,其中2株植生克雷伯菌对β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类抗菌药物呈多重耐药性,仅对亚胺培南和美洛培南敏感;  (3)本组克雷伯属菌均检出不同种类的β-内酰胺酶编码基因;  (4)本组克雷伯菌属菌8种氨基糖苷类修饰酶基因检出aac(3)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰb群、ant(3”)-Ⅰ和aph(3’)-Ⅰ等4种;  (5)本组克雷伯菌属菌均检出不同的喹诺酮类耐药相关基因;  (6)本组克雷伯菌属菌均检出不同的可移动遗传元件标记;  (7)本组克雷伯菌属菌利福平类药物获得性耐药基因arr-2/3的阳性率为65%,而消毒剂类获得性耐药基因qacE△1的阳性率为100%;  (8)18株肺炎克雷伯菌外膜孔蛋白基因ompK35、ompK36的突变率均为100%;(9)指标聚类分析显示KPC与ISKpn6高度关联,SHV、qacE△1与intⅠ1、tnp315、IS26高度相关联;  (10)本组克雷伯菌中,2株植生克雷伯菌与18株肺炎克雷伯菌处在二个不同的簇群中,18株肺炎克雷伯菌可分为A与B二个簇群。  结论:克雷伯菌的多药耐药与细菌携带的多种耐药基因密切相关,而获得性耐药基因则与多种可移动遗传标记相关,流行的肺炎克雷伯菌之间具有密切的亲缘性。
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