Toll样受体信号通路基因单核苷酸多态性和DNA甲基化水平与新疆维吾尔族慢性牙周炎的相关性研究

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目的:慢性牙周炎(chronic periodontitis,CP)是牙周组织的最常见的炎症性疾病,牙周支持组织因炎性病变而遭到破坏,是目前人牙齿缺失的重要原因之一。慢性牙周炎是环境因素和遗传因素等多因素共同作用下发生的疾病,遗传因素在慢性牙周炎的发病过程中起到了极其重要的作用。Toll样受体信号通路中的基因及其SNP与慢性牙周炎易感性之间的研究结果存在着不同程度的差异,有着不同的争议与矛盾。尤其这些研究并没有在新疆人群中进行过研究,极大地限制了我们对新疆地区慢性牙周炎疾病的特有的了解与认知,阻碍了新疆少数民族人群的慢性牙周炎疾病个体化用药和精准医疗的发展速度。我们的研究通过三步骤研究来系统性的开展对慢性牙周炎在新疆墨玉县的样本中的相关性研究:1)对新疆墨玉县维吾尔族成人进行慢性牙周炎流行病学调查及危险因素分析,建立墨玉县维吾尔族成人慢性牙周炎的流行病学及相关高危因素的数据库及血尿的生物标本库;2)利用高通量SNP基因分型技术i MLDR技术对Toll样受体信号通路基因IKBKE,IL6,IL1B,CXCL8,STAT1,IL-8等进行SNP分型,比较慢性牙周炎患者和对照组之间基因型及单体型频率的分布差异,从而探讨IKBKE,IL6,IL1B,CXCL8,STAT1,IL-8等基因多态性和慢性牙周炎之间的关系及其差异,并采用双荧光素酶报告系统明确阳性位点对基因表达的影响,初探阳性位点导致慢性牙周炎的机制;3)采用Methyltarget高通量DNA甲基化水平分析技术对Toll样受体信号通路基因启动子区DNA甲基化水平进行检测,并利用RT-PCR技术检测外周循环血中阳性基因m RNA表达水平,解析导致慢性牙周炎发生的表观遗传学调控作用,利用人牙龈成纤维细胞明确阳性基因表达改变导致慢性牙周炎发生的机制,并为慢性牙周炎临床诊断和预后判断提供新的方向。方法:1)采用分层、多阶段、整群的横断面研究方法将墨玉县人群进行流行病学调查,然后计算分析慢性牙周炎患病率,采用单因素分析法来寻找牙周炎的流行因素;2)对Toll样受体信号通路中的IKBKE,IL6,IL1B,CXCL8,STAT1等基因进行研究,根据2个在线数据库NCBI的db SNP和SNPinfo,选择10个SNP位点,在墨玉县慢性牙周炎患者和健康对照群里中进行分型基因多态性检测,关联分析确定Toll样受体信号通路与新疆墨玉县慢性牙周炎的相关性,随后构建阳性位点定点突变细胞株,明确阳性位点对基因表达对影响,初步探明阳性位点致病机制;3)我们从研究中筛选发病年龄小、牙周炎疾病表型严重且未经药物干预的患者30例,以及年龄、性别匹配的健康个体30例作为研究对象,采用Methyltarget技术对Toll样受体信号通路IKBKE,IL6,IL1B,CXCL8,STAT1等基因启动子区CpG岛进行DNA甲基化水平分析,筛选和慢性牙周炎相关的DNA甲基化位点和基因,利用实时荧光定量PCR检测基因表达量,明确对Toll样受体信号通路基因DNA甲基化水平影响m RNA表达水平在慢性牙周炎中的作用,随后对人牙龈成纤维细胞株进行FPR1基因过表达和敲降,明确FPR1基因表达降低导致成纤维细胞活力显著减弱,明确FPR1在慢性牙周炎中的作用机制。结果:1)慢性牙周炎患者年龄、体重、腰围、臀围、血肌酐、甘油三酯、总胆固醇等指标均显著高于健康个体,男性患病率80.04%,女性患病率69.87%,患病率性别差异不显著(P>0.05),发现慢性牙周炎患者平均年龄为43.05±12.23岁,健康个体平均年龄为32.22±10.54岁,CP患病率随年龄段增长呈明显增加趋势(P<0.001),最高患病率为60岁以上的年龄段;2)FPR1基因rs2070745位点突变型等位基因G携带者的慢性牙周炎患病风险呈上升趋势(OR(95%CI)=1.42(1.05-1.90,P=0.02)且在不同遗传模型下,对慢性牙周炎具有保护作用,BRAF基因rs10487888位点基因型T/T与慢性牙周炎的患病风险升高相关(OR(95%CI)=1.99(1.05-3.77,P=0.035),STAT1基因rs3771300在显性和超显性模型中均会增加CP风险,FPR1基因rs2070745位点T等位基因的荧光素酶活性显著高于C等位基因;3)BRAF基因CpG island中BRAF1片段43、68、81、95、113、121bp的CpG位点,BRAF2片段98bp,STAT1基因CpG island中第66、83、93、102、120bp的CpG位点,CXCL8基因CpG island中第51、57、72、88、106、150bp的CpG位点,IL-6基因CpG island中IL61片段第35、41、47、62、64、68、87、90、105、108、114、117、122的CpG位点和IL62片段第36、67、83bp的CpG位点的甲基化水平在慢性牙周炎和健康组之间存在显著差异(P<0.05),多个CpG位点组合的单倍体型在CP和对照组间存在显著差异,而BRAF、STAT1、CXCL8基因表达水平字慢性牙周炎患者和健康对照组之间差异不显著。FPR1基因表达降低导致成纤维细胞活力显著减弱,可能是慢性牙周炎可能的致病机制。结论:1)在新疆墨玉县维吾尔族人群中慢性牙周炎发病与性别不相关而与年龄、体重、腰围、臀围、血肌酐、甘油三酯、总胆固醇等一般资料中的其他指标密切相关,这些指标是慢性牙周炎发病高风险因素;2)Toll样受体通路相关基因的FPR1-rs2070745、BRAF-rs10487888和rs3771300的位点多态性与新疆维吾尔族人群慢性牙周炎的疾病易感性相关;FPR1基因rs2070745 T等位基因可能影响FPR1基因表达,影响慢性牙周炎的发生和发展。3)BRAF、STAT1、CXCL8和IL-6基因的CpG位点的甲基化水平在慢性牙周炎和健康组之间存在显著差异(P<0.05),慢性牙周炎患者外周循环血中IL-6表达水平显著高于健康个体(P<0.05),IL-6基因启动子区DNA甲基化水平下降导致了IL-6基因表达水平上升最终引起慢性牙周炎易感,但BRAF、STAT1、CXCL8 DNA甲基化水平差异不是导致慢性牙周炎易感的主因。FPR1基因表达下调可能抑制人牙龈成纤维细胞生长、降低人成纤维细胞活性,从而影响mRNA转录和蛋白表达,导致慢性牙周炎的发生发展。
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