近几年来，屡见不鲜的企业破产、公司倒闭的现状，说明内部控制的有效运行不仅取决于内部控制制度的完善程度，而且取决于公司投资者对内部控制有效性信息的重视和公司治理层对内部控制的有效监督。因此，要保证内部控制的有效运行，充分发挥内部控制保障财务信息可靠性的作用，切实保护投资者的利益，就必须强化内部控制治理职能。本文首先通过对国内外关于内部控制治理功能的论述及研究成果进行分析研究，研究内部控制治理功能的涵义、主要表现和发挥途径，强调要从审计委员会对内部控制的监督指导，内部审计负责人对董事会汇报工作以及外部审计人员对内部控制出具的评价报告方面发挥内部控制的治理功能。接着通过实证分析的方法论证内部控制治理功能的有效发挥能够提高企业绩效的假设，得出了第一大股东对上市公司的控制力度，董事会的内部制衡作用，董事长是否兼任总经理以及是否设置审计委员会对企业绩效的影响有限；外部董事会的比例和中小股东参与治理、制约大股东的效率对企业绩效有明显的影响。最后分析了我国企业内部控制治理功能发挥主要存在的内部控制主导者独立性问题、内部授权行为问题、内部审计观念问题、内部控制信息披露问题以及人员素质问题，提出有效的应对措施，包括建立由独立董事组成的审计委员会；针对企业各个控制环节的需要进行不同程度、不同范围及不同重点的授权；将内部审计的重点从内部检查和监督向内部分析和评价方面转变；明确界定内部控制信息披露的责任主体，应当建立完善的内部控制信息披露体系，并对其进行规范；鼓励上市公司自愿披露内部控制信息，并对其进行监督管理；企业建立长效激励机制。