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背景/目的:自身免疫性胰腺炎（Autoimmune Pancreatitis,AIP）是一类特殊类型的胰腺炎,常表现为梗阻性黄疸或腹部不适,目前病因不明确。AIP患者与胰头癌（Pancreatic Head Cancer,PCH）患者往往临床症状相似,两者鉴别诊断困难。相较于AIP,PCH预后较差、进展快且常需手术切除治疗,为了提高PCH患者预后及减少AIP患者不必要的手术,找到鉴别两者的方法至关重要。目前,临床上关于AIP患者的肠道菌群变化研究较少,AIP与PCH及慢性胰腺炎（Chronic Pancreatitis,CP）之间菌群差异也尚不清楚。本研究试图初步阐明AIP患者肠道菌群变化特征及其与PCH、CP等疾病的肠道菌群差异。方法:纳入2018年9月至2019年9月期间在长海医院消化内科住院治疗的23例1型AIP患者（AIP组）、30例CP患者（CP组）、17例PCH患者（PCH组）,并于附近社区募集30名健康对照者为HC组（Health Controls,HCs）。分别收集患者粪便样本进行16S rRNA测序分析菌群的构成。收集AIP组及PCH组患者血清,使用Quantibody（?）阵列玻璃芯片20种细胞因子。通过高通量测序分析AIP组与HC组、PCH组及CP组间肠道微生态多样性、丰富性及构成差异,并对菌群代谢通路变化进行预测,最后对肠道菌群丰度和血清细胞因子浓度进行Spearman关联性分析。结果:以上纳入四组人群在性别、年龄、体重指数（BMI）方面差异无统计学意义（P>0.05）。AIP组与HC组、PCH组及CP组之间α多样性均无显著差异（P>0.05）。β多样性中,PCoA分析（Principal Co-ordinates Analysis）结果显示AIP患者与健康对照相比表现出明显的肠道菌群结构变化（PCoA分析:R=0.3353,P=0.001,weightedunifrac test;R=0.2720,P=0.001,unweighted unifrac test）。PCoA 分析提示 AIP 与 CP 患者相比,肠道菌群结构有显著差异（R=0.0690,P=0.025,weightedunifractest;R=0.1100,P=0.008,unweighted unifrac test）。而AIP组与PCH组之间则未表现出明显差异（R=0.0216,P=0.260,weighted unifrac test;R=0.0454,P=0.124,unweighted unifrac test）。与HC组相比,门水平上,AIP组拟杆菌门（pBacteroidetes）的丰度明显低于HC组,而变形菌门（pProteobacteria）丰度显著高于HC组。属水平上,AIP组gEscherichia-Shigella、gStreptococcus、gVeillonella、gPrevotella7 的丰度显著增加,而gBacteroides、gEubacteriumrectalegroup、gRoseburia 的丰度显著减少。与PCH组患者相比,AIP组gStreptococcus丰度显著增加,而gPhascolarctobacterium属丰度水平显著减少。与CP组相比,AIP组患者gStreptococcus、gVeillonella、gPrevotella7 及 gLactobacillus 丰度显著增加,而gLachnoclostridium 属丰度水平显著减少。AIP患者gStreptococcus与血清巨噬细胞炎性蛋白-3α（Macrophage Inflammatory Proteins,MIP-3α）相关（r=0.56）。结论:本研究结果提示1型AIP患者肠道菌群在多样性、丰富度上与PCH患者、CP患者、健康对照相比无显著差异。但是AIP患者在肠道菌群结构上存在失调,其肠道菌群结构与PCH患者无显著差异,而与CP患者、健康对照有显著差异。本研究同时发现gStreptococcus在AIP患者明显富集,且与PCH、CP、健康对照者相比有显著差异,提示了其作为AIP诊断或鉴别诊断的生物学标志物的可能性。