2020年伊始,新冠疫情在全国范围内陆续爆发,此次疫情辐射范围甚广,给经济、社会、生活等诸多方面造成不利影响。疫情爆发后,党中央迅速组织相关部门开展防控工作,同时下达了大量财政资金用于支持防控工作的正常开展。如何确保疫情防控专项资金高效益地使用,成为国民关注的重点,为此,审计署于2020年2月7日印发《关于做好新型冠状病毒肺炎疫情防控财政资金和捐赠款物审计监督工作的通知》（审财发[2020]3号）,对如何开展疫情防控资金专项审计做出具体指导,并鼓励各机关依据当地疫情形势选择合适的审计方式。如何能够更好地在疫情这种特殊环境下做好审计工作,发挥审计职能,对疫情防控专项资金做到全方位的高效审计,使得应急审计中审计方式的创新应用成为相关部门关注的重点。当前国内可借鉴的应急审计经验较少,关于审计方式的创新应用等方面的研究更是寥寥可数,在这个探索阶段,发生突发性公共卫生事件时,审计工作的组织开展仍面临着诸多难点,那么在疫情环境下探讨应对突发性公共事件审计方式创新应用,积累相关经验则具有重大意义。本文以疫情期间采取非现场审计方式的三个典型案例为例,首先对疫情防控资金专项审计工作的背景进行阐述,再对相关的防控政策以及资金保障措施进行解读,并对疫情防控资金专项审计的应对现状作了简要概述。其次对所选取的案例进行了更具体的分析,主要从其组织形式、审计结果、整改情况等方面指出疫情防控资金专项审计工作中非现场审计方式的应用存在的局限性,如:审计风险的评估受阻、审计证据的真实性、完整性鉴定受限、审计资源的集约化利用程度不高、应急审计预案不完善等。针对上述不足,为完善非现场审计应用环境,本文提出了如下建议:增加应急审计人才储备,组建应急审计专业团队,把控审计风险;加快智慧审计基础建设工作,提高审计质量;做好突发性事件阶段规划,明确审计工作重点,结合实际情况加强协调能力,充分整合审计资源;从制度层面完善应急审计预案管理作为常备措施,形成具体的业务指南,使应急审计工作能够有组织、有计划地开展。