AM真菌（arbuscular mycorrhizal fungi）在自然界分布极其广泛，能在许多类型的土壤中存活，80％的陆生植物可以和AM真菌共生。土壤的肥力、水分、pH、环境的光照条件、温度等因素都会影响菌根真菌与植物的共生效应。不同的因素会影响AM真菌的侵染率、产孢量以及菌根效应。本论文以AM真菌为研究对象，探讨了不同pH下（4.3、5.1、5.8、6.8），两种VA菌根真菌Glomus mosseae，Gigaspora margarita单接种及混合接种对紫云英生长的影响以及两者之间的相互作用。采用Trouvelot等（1986）的方法进行曲利苯蓝（Trypan blue）染色，根据染色结果侵染点和侵染结构的多少，将AM真菌的侵染率分为0、1、2、3、4、5六个等级，侵染强度分为A₀、A₁、A₂、A₃四个等级，用“MYCOCALC”软件计算了宿主根系菌根侵染强度，记为M％。同时参考Zhao et al．（1997）的组织染色法，检测在不同pH条件下琥珀酸脱氢酶（SDH）和碱性磷酸酶（ALP）的活性。通过对紫云英地上和地下部分生物量的测定，结果表明紫云英的生长效应与VA菌根真菌的侵染率及两种酶活成明显相关性。土壤pH升高，单接种Glomus mosseae和混合接种时的侵染率和酶活随之升高；而单接种Gigaspora margarita的侵染率和酶活则呈现出先上升后下降的趋势，在pH5.8时达到最大值。同时根据根外菌丝长度的测量（Miller，Jastrow et al．2000），揭示了菌根真菌的侵染率与根外菌丝密度的关系。通过对AM真菌核糖体基因25SrDNA的D1-D2高度可变区的序列分析，设计了特异性扩增Glomus mosseae和Gigaspora margarita的引物gm1和gig1，能够从AM真菌混合侵染的植物根系中特异性检测出相应的真菌。在混合接种实验中，利用所设计的特异性引物进行nested PCR，扩增结果显示：在低pH水平下（4.3-5.1），大多数根段为Gigaspora margarita所侵染，在高pH水平下（5.8-6.8），Glomus mosseae表现出较强的竞争力，但并没有检测到两种VA真菌存在于同一条侵染根段；对比单接种实验，在低pH水平下，Glomus mosseae显著抑制了Gigaspora margarita的侵染，而在高pH水平下Gigaspora margarita明显促进Glomus mosseae的侵染。分子探针及嵌套PCR技术的使用，揭示了AM真菌之间的相互关系，为正确评价高效菌株的应用潜力建立了科学、实用的技术平台，为深入研究AM真菌的分子生态学提供了技术条件。