豆梨响应黑斑病菌侵染的转录组分析及PcNAC1基因功能鉴定

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jdalian1417
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
梨属于蔷薇科(Rosaceae)梨属(Pyrus)植物,为落叶乔木,原产于我国,是一种广泛栽培的温带水果,具有重要的经济价值。豆梨(Pyrus calleryana Dence)因具有较强的抗病能力及生长适应性,耐贫瘠、耐干旱、易于管理,在生产上常作为梨的嫁接砧木被广泛利用。目前植物病原菌的侵染为影响我国梨产量的主要因素,其中由链格孢菌(Alternariaalternate)引起的梨黑斑病是严重危害梨树的真菌病害之一。挖掘相关抗病基因有利于揭示梨对黑斑病的抗病机制,为培育抗病新品种提供依据。本文通过构建黑斑病病菌侵染前后的豆梨叶片转录组文库,高通量测序后筛选差异表达基因;分离获得一个表达量差异明显的PcNAC1基因,进一步对其表达提点、亚细胞定位和抗病功能进行验证。本论文的主要研究结果如下:(1)通过转录组测序(RNA-Seq)技术比较了豆梨接种黑斑病病菌前后的转录基因表达谱,共检测出73.3Gb的clean data,以中国白梨砀山酥梨(Pyrus bretschneideri Rehd)的基因组测序数据(http://peargenome.njau.edu.cn/)作为参照基因组,表达谱中基因进行map比对,鉴定出2090个差异表达基因。功能注释的结果表明,黑斑病菌的侵染可引起植物新陈代谢的极大变化。对差异基因进行GO富集分析表明,这些差异表达基因广泛参与植物光合作用及信号传导过程。其中包括很多转录因子基因,可能参与植物Ca2+信号调节、乙烯及茉莉酸调节途径等。差异表达的转录因子基因中,乙烯反应途径相关的转录因子属于第IX大类,包括ERF1、ERF7、ERF105,表达量上调1.03~2.37倍,表明它们均参与对病原菌的防御反应;上调表达的NAC2、NAC4、MYB44和bHLH28等多种转录因子均参与应对生物胁迫的防御过程。此外,我们鉴定出144个长链非编码RNA(lncRNAs),这为解释长链非编码RNA在抵抗梨黑斑病的作用提供了新的视角。本研究为豆梨黑斑病的防治提供了分子遗传学及功能基因组信息,以期为梨抗病新品种的选育提供理论依据。(2)根据豆梨接种黑斑病后的转录组测序结果,筛选出一个上调表达的NAC转录因子基因。为进一步了解该基因在豆梨对抗外界胁迫反应中所发挥的作用,通过设计引物进行PCR扩增,成功地从豆梨中获得了该基因的全长片段,并将其命名为PcNAC1。该基因开放阅读框的碱基数为792 bp,编码了 263个氨基酸。将豆梨PcNAC1蛋白序列与其他物种蛋白序列进行对比,并构建系统进化树,分析后发现其与小麦中TaNAC4及拟南芥中ATAF1具有较高的同源性。通过实时荧光定量分析PcNAC1基因在豆梨不同组中的表达,结果发现,PcNAC1基因在茎、叶和根中表达量较高,在花和果中表达量较低。构建了亚细胞定位载体,瞬时侵染本氏烟,通过激光共聚焦显微镜观察融合蛋白在细胞内的分布情况,结果发现,该基因行使功能的主要区域定位在细胞核。进一步在本氏烟中瞬时表达PcNAC1基因,接种烟草疫霉病菌后发现PcNA4C1可以通过调控植物激素通路防卫反应基因的表达来增强植物的抗病性。
其他文献
氧化钒(VOx)薄膜由于其特殊的相变性能而受到国内外研究人员广泛的关注,相变过程中所产生的光透过率、电阻率和磁化率的突变,使其在众多领域有重要的应用价值。但是,钒氧化物
目的 胆管癌是临床较常见的胆道恶性肿瘤,目前仍然缺乏有效的治疗方法。而近年来,XIAP(X染色体连锁凋亡抑制蛋白)的抗凋亡作用受到重视,对肿瘤发生、发展及预后有多方面的影
<正>电信运营商进军互联网金融在近几年并不少见,但发展状况一直不尽如人意,即便是发展最好的中国电信翼支付在移动支付市场也仅处于第三梯队,市场份额不足1%。当前,中国互联
巴丹吉林沙漠中很多盐湖呈现碱性,盐度最高达到470 g/L,p H在9至11之间。同时,由于地下水的补给,沙漠中有许多淡水湖,因此盐度呈现梯度变化,微生物资源非常丰富。本研利用分
量化林分空间水平上的林木多样性对于评价林分的经济、生态、社会价值及其经营措施具有重要意义。本研究以长白山过伐林区特有的半天然落叶松云冷杉混交林为研究对象,分别运用树种组成、树种重要性、直径分布结构、物种和径阶多样性和邻近木多样性指数、空间密度指数、开敞度、混交度、大小比数、竞争指数等指标,对金沟岭林场4块不同落叶松组成的林分的非空间结构和基于不同邻近木单元的空间结构特征进行量化分析,比较了落叶松云
NaP分子筛的GIS结构、斜碱沸石骨架等特点决定其具有良好的金属离子交换能力和吸附能力,可广泛应用于气体吸附,重金属元素、放射性物质去除等领域。NaP型分子筛对Ca2+和Mg2+
目的 利用 P.acnes引起的炎症反应促进小鼠外周血中树突状细胞(Dendritic cell, DC)的动员,并探讨其间可能存在的机制,在此基础上,检验 P.acnes动员的DC在胃癌治疗中的作用。
<正>一、研究背景20世纪70年代,欧美兴起大学与中小学结为伙伴、合作探索中小学学校改进及教师专业发展等问题(即"University-School Partnership",简称"U-S"伙伴合作或"U-S"
目的:食管癌外科治疗后,局部复发和远处转移是患者死亡的主要原因之一,因此准确判断淋巴结的转移情况有重大的临床意义。本课题的目的是为了研究免疫组化法对淋巴结微转移的诊断
目的:探讨中医功能社区高血压人群阴虚阳亢证与肱动脉血流介导的舒张功能(flow-mediated dilation FMD)之间是否存在相关性。方法:以山东省平原县高血压中医功能社区2013和20