四氯化碳诱导小鼠肝脏组织纤维化的蛋白质组学研究

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从世界范围来看,饮酒、肝炎病毒感染和非酒精性脂肪性肝炎是促使肝组织慢性损伤发展形成纤维化、肝硬化和肝癌的三大主要原因【1】。早在20世纪70年代,就有研究显示肝脏组织纤维形成是一个可逆化的过程【2】,Schaffner等也证明肝纤维化是慢性肝损伤发展进程中最后一个可逆化病理应答阶段【3,4】。本研究的目的是,腹腔皮下注射四氯化碳(CCl4,Carbon tetrachloride)诱导小鼠(C57BL/6)肝组织纤维化的形成,同时,对照组注射橄榄油(溶剂),诱导期限为15周;首先对两组小鼠肝脏组织的全蛋白表达谱进行质谱鉴定,发现并探讨纤维化肝组织与正常肝组织在蛋白质组水平上的差异,包括差异蛋白表达谱的分析以及差异蛋白的功能和信号通路富集分析。方法:实验小鼠随机分为两组,由橄榄油和四氯化碳诱导15周,并分别对这两组肝组织的全蛋白表达谱进行质谱检测,本研究应用基于肽段峰面积强度的定量方法(Intensity based absolutequantification, or iBAQ)【5】,对鉴定到的蛋白质进行定量,依照两组内iBAQ值之间的比值对特定蛋白的表达变化进行评定,总结纤维化肝脏组织中差异表达蛋白谱。应用GO(Gene Ontology)功能分类分析和KEGG (Kyoto Enyoolpedia ofGenes and Genomes)信号通路的富集分析方法对鉴定到的全蛋白表达谱进行差异表达分析。结果:在对照组和实验组中,我们分别鉴定到17382和20486条unique肽段,图谱平均利用率大于50%,共计鉴定到蛋白4991种(蛋白特异性肽段个数至少为1),其中差异表达蛋白有2135种(差异倍数大于或等于2),表达上调蛋白1264种,下调蛋白871中。结论:纤维化肝脏组织中与细胞外基质组成(Extracellular matrix organization)、细胞骨架组成(Cytoskeleton organization)、有机磷酸代谢(Organophosphate metabolic process)、细胞定位(Cellular localization)和细胞组分调节(Regulation of cellular component organization)相关蛋白的表达是上调的;另外,与小分子代谢(Small molecule metabolic process)、蛋白质转运(Protein transport)和有机氮化合物的代谢(Organonitrogen compound metabolicprocess),以及四吡咯的合成过程(Tetrapyrrole biosynthetic process)有关蛋白的表达是下调的。信号通路富集分析结果表明,纤维化与VEGF和T细胞受体信号调节通路密切相关;四氯化碳诱导组中发现有20种属于剪切体的蛋白表达是下调的,下调蛋白中与硫胺素代谢(Thiamine metabolism)、聚糖降解(Other glycandegradation)、SNARE相关囊泡运动(SNARE interactions invesicular transport)、牛磺酸和亚牛磺酸代谢(Taurine and hypotaurine metabolism)、初级胆酸合成(Primary bile acid biosynthesis)以及泛酸与CoA的合成(Pantothenate and CoAbiosynthesis)通路相关蛋白的富集度都高于18%,提示,纤维形成,可能与肝组织和神经细胞代谢功能异常是密切相关的,另外,血管循环系统的功能异常有可能与纤维形成过程相关;纤维化的形成不仅是一个复杂的信号转导过程,更是一个炎症与免疫相互促成的结果;增强肝实质细胞的存活,降低相关信号的传递及接收都有可能对纤维化的发生和发展起到抑制效果。
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