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目的： 对内蒙古地区2012～2014年流感样病例和流感病原学进行监测，分析其流行特征，并了解毒株的基因变异情况，为流感疫情的防控提供科学依据。 方法： 内蒙古各盟市哨点医院向“中国流感监测信息系统”上报流感样病例，并收集流感样病例样本，送至各盟市流感网络实验室，用Real-time RT-PCR或RT-PCR方法进行核酸检测，检测结果录入“中国流感监测信息系统”，整理数据并用Office Excel绘制流行病学曲线，采用SPSS13.0软件进行统计分析；用MDCK细胞和鸡胚分离培养流感病毒，阳性的样本进行型和亚型的鉴定，选取部分分离株测定的HA和NA基因的全序列，分析这些分离株与参比株和疫苗株的遗传进化关系。 结果： （1）2012～2014年，全区共报告流感样病例分别为27957例、41853例和75832例，3年报告流感样病例占门急诊就诊的比例分别为1.49％、1.76％和2.94％；第一季度和第四季度为流感样病例报告的高峰期，ILI%为2.32%和2.30%，第三季度为低水平期，ILI%为1.71%。 （2）2012～2014流感样病例年龄分布情况为5岁以下组构成比最高，为55.03％，其次顺序为5～，25～，15～，60～岁组。 （3）东中西部地区ILI%差异有统计学意义。 （4）核酸检测结果为2012～2014年阳性率分别为11.48%、7.48%和12.25%；2012～2014年核酸检测阳性率总体有两个高峰期（1～4月和11～12月）和一个低水平期（5～10月）；2012年高峰期阳性率为15.57％，春季优势型别分别为B型，冬季优势型别为A(H3N2)；2013年高峰期阳性率为10.60％，春季优势型别由A(H3N2)逐渐变为新甲型H1N1，冬季优势型别为新甲型H1N1；2014年高峰期阳性率为15.50％，春季优势型别为B型，冬季优势型别为A(H3N2）。 （5）性别核酸阳性率差异无统计学意义。 （6）2012～2014共分离得到流感病毒96株，其中B victoria系18株，Byamagata系51株，新甲型H1N1流感病毒27株。 （7）选取5株新甲型H1N1和6株B型流感病毒分离株进行基因测序，新甲型H1N1分离株HA和NA基因与疫苗株、中国代表株和2009年的内蒙古参比株不在一个进化分支，新甲型H1N1分离株HA基因与A/Shanghai/6019T/2014、A/Wisconsin/09/2013和A/Beijing/14-2/2014的同源性较高；新甲型H1N1分离株NA基因与A/Shanghai/6019T/2014、A/Wisconsin/09/2013和A/Beijing/14-2/2014的同源性较高。4株Yamagata系分离株HA基因与B/Beijing/13-21/2013和B/Florida/3038/2012的同源性高，与疫苗株B/Wisconsin/01/2010和B/Massachusetts/2/2012在同一个进化分支；2株Victoria系分离株与B/Hong Kong/259/2010和B/Iowa/01/2010同源性较高，与疫苗株B/Brisbane/60/2008在同一个进化分支；6株B型流感病毒分离株的NA基因与疫苗株B/Brisbane/60/2008在同一个进化分支，分离株与B/Fujian-Gulou/1272/2008的同源性较高。 结论： （1）内蒙古流感的流行具有明显的季节性，即春季和冬季高发；5岁以下儿童在流感样病例中所占比例最高；东中西部地区ILI%不同。 （2）2012～2014年内蒙古每年均有两个流感流行期，流感流行期内优势型别(A(H3N2)、B型、新甲型H1N1）交替变化。 （3）流感病毒分离株的HA和NA基因，与部分国内外参比株亲缘关系近，进化不是独立进行的；WHO推荐的疫苗株不完全适合本次实验选取的分离株。